Lagi

Tidak dapat mencetak di GeoExplorer (Masalah Komunikasi: Status tidak ditentukan)

Tidak dapat mencetak di GeoExplorer (Masalah Komunikasi: Status tidak ditentukan)


Pengaturan dan informasi perangkat lunak

Saya menggunakan GeoExplorer untuk mengakses lapisan yang dilayani oleh GeoServer (di localhost saya) yang pada gilirannya ditautkan ke database PostGIS (lokal lagi). Saya menggunakan GeoServer 2.5, jadi saya mengunduh plugin cetak v2.5 dan mengikuti instruksi di sini.

Masalah

Ketika saya mengklik tombol cetak, pratinjau cetak muncul dan saya dapat mengedit opsi pencetakan saya seperti yang diharapkan. Namun ketika saya mencoba untuk Mencetak, perangkat lunak mencoba "Ekspor ke PDF" tetapi gagal, menghasilkan kotak kesalahan yang menyatakan: "Masalah Komunikasi: Status tidak ditentukan"

Langkah-langkah yang diambil untuk menyelesaikan masalah

Saya telah mencoba bermain dengan file config.yaml yang terletak di direktori GeoServer menurut dokumentasi MapFish ( http://www.mapfish.org/doc/print/configuration.html ) tetapi karena baru dalam semua ini, saya belum tidak dapat membuatnya bekerja… Saat ini saya menggunakan file config.yaml standar yang dihasilkan ketika saya me-restart GeoServer setelah menginstal plugin cetak (ditempelkan di bawah)

Config.yaml:

#================================================== ========================== # DPI yang diizinkan #====================== ================================================== ===== dpis: [75, 150, 300] #================================== ======================================= # timbangan yang diizinkan #====== ================================================== =================== timbangan: - 25000 - 50000 - 100000 - 200000 - 500000 - 1000000 - 2000000 - 4000000 #============ ================================================== =============== # daftar host yang diizinkan #============================== ============================================== Host: - ! localMatch dummy: true - !ipMatch ip: www.camptocamp.org - !dnsMatch host: demo.opengeo.org port: 80 - !dnsMatch host: terraservice.net port: 80 - !dnsMatch host: sigma.openplans.org - ! dnsMatch host: demo.mapfish.org layout: Legal: mainPage: pageSize: LEGAL item: - !map spacingAfter: 30 width: 440 height: 483 #================== =============================== ============================ Potret A4: #================== ================================================== ======= metaData: # title: '${mapTitle}' author: 'MapFish print module' subject: 'Simple layout' keywords: 'map,print' creator: 'MapFish' titlePage: pageSize: A4 item: - !text spacingAfter: 150 - !text font: Helvetica fontSize: 40 spacingAfter: 100 align: center text: '${layout}' - !image maxWidth: 160 maxHeight: 160 spacingAfter: 100 align: center url: http:// trac.mapfish.org/trac/mapfish/attachment/ticket/3/logo_v8_sphere.svg?format=raw footer: &commonFooter height: 30 item: - !columns config: cells: - paddingBottom: 5 item: - !text backgroundColor: # FF0000 align: teks kiri: kotak merah - !text align: teks kanan: 'Page ${pageNum}' - !image align: center maxWidth: 100 maxHeight: 30 spacingAfter: 200 url: 'http://geoserver.org/ unduh/lampiran/10158143/pbGS-Bttn228x68.png">

Konfigurasi ini dalam kasus saya, berfungsi dengan baik:

dpis: [75, 150, 300] skala: - 524288000 - 262144000 - 131072000 - 65536000 - 32768000 - 16384000 - 8192000 - 4096000 - 2048000 - 1024000 - 512000 - 256000 - 128000 - 64000 - 32000 - 16000 - 8000 - 4000 - 2000 - 1000 host: - !localMatch dummy: true - !ipMatch ip: 0.0.0.0 mask: 0.0.0.0 layout: A4: metaData: &commonMetaData title: "${mapTitle}" author: "xxxx" subject: "yyyyy" keywords: " map,print" pencipta: "OpenGeo Suite" mainPage: pageSize: A4 rotation: true item: - !text text: "${mapTitle}" fontSize: 30 spacingAfter: 30 align: center - !map spacingAfter: 10 width: 440 height : 600 - !scalebar type: bar maxSize: 100 barBgColor: white fontSize: 8 align: right spacingAfter: 10 - !text text: "${comment}" Legal: metaData: *commonMetaData mainPage: pageSize: LEGAL rotation: true item: - !teks teks: "${mapTitle}" fontSize: 30 spacingAfter: 30 align: center - !map spacingAfter: 10 width: 440 height: 650 - !scalebar type: bar maxSize: 100 barBgColor: white fontSize: 8 align: right spasiAft er: 10 - !text text: "${comment}" Letter: metaData: *commonMetaData mainPage: pageSize: LETTER rotation: true items: - !text text: "${mapTitle}" fontSize: 30 spacingAfter: 30 align: center - !map spacingAfter: 10 width: 440 height: 550 - !scalebar type: bar maxSize: 100 barBgColor: white fontSize: 8 align: right spacingAfter: 10 - !text text: "${comment}"

Tidak dapat mencetak di GeoExplorer (Masalah Komunikasi: Status tidak ditentukan) - Sistem Informasi Geografis

Kamis, 31 Desember 2015

Dewey, E. B., Sanchez, D. dan Johnston, C. A. (2015). Kutil memfosforilasi Lumpur untuk mempromosikan orientasi spindel mitosis yang dimediasi Pin di Drosophila, terlepas dari Yorkie. Curr Biol 25: 2751-2762. ID PubMed: 26592339
Ringkasan:
Hewan multiseluler telah mengembangkan jalur pensinyalan yang dilestarikan yang menerjemahkan isyarat polaritas sel ke dalam posisi gelendong mitosis untuk mengontrol orientasi pembelahan sel dalam struktur jaringan yang kompleks. Pembelahan sel yang berorientasi ini sangat penting untuk pengembangan keragaman sel dan pemeliharaan homeostasis jaringan. Meskipun upaya intens, mekanisme molekuler yang mengontrol orientasi gelendong tetap tidak lengkap. Studi ini menjelaskan peran kompleks Hippo (Hpo) kinase dalam mempromosikan orientasi spindel yang dimediasi Partner of Inscuteable (Pins). Knockdown Hpo, Salvador (Sav), atau Warts (Wts) masing-masing menghasilkan hilangnya sebagian orientasi spindel, sebuah fenotipe yang sebelumnya dijelaskan setelah hilangnya protein pengikat Pins Mushroom body defect (Lumpur). Mirip dengan ortolog yang mencakup ragi hingga mamalia, Wts kinase melokalisasi ke kutub gelendong mitosis, situs yang menonjol dari lokalisasi Lumpur. Wts secara langsung memfosforilasi Lumpur secara in vitro dalam domain kumparan melingkar terminal-C. Domain koil-koil Lumpur ini secara langsung mengikat domain pengikat Pin yang berdekatan untuk meredam interaksi Pin/Lumpur, dan fosforilasi yang dimediasi Wts memisahkan interaksi Lumpur intramolekul ini. Hilangnya Wts mencegah asosiasi Pin / Lumpur kortikal tanpa mempengaruhi akumulasi Lumpur di kutub spindel, menunjukkan fosforilasi bertindak sebagai sakelar molekuler untuk secara khusus mengaktifkan fungsi Lumpur kortikal. Akhirnya, hilangnya Wts dalam sel epitel cakram imaginal Drosophila menghasilkan Lumpur kortikal yang berkurang dan orientasi gelendong planar yang rusak. Hasil ini memberikan wawasan baru ke dalam dasar molekuler untuk regulasi dinamis kompleks pemosisian spindel Pins / Lumpur kortikal dan menyoroti tautan baru dengan jalur proliferasi sel yang dilestarikan secara evolusioner.

Siudeja, K., Nassari, S., Gervais, L., Skorski, P., Lameiras, S., Stolfa, D., Zande, M., Bernard, V., Rio Frio, T. dan Bardin, AJ ( 2015). Mutasi somatik yang sering terjadi pada sel induk usus dewasa mendorong neoplasia dan mosaik genetik selama penuaan. Sel Induk Sel 17: 663-674. ID PubMed: 26607382
Ringkasan:
Sel induk dewasa dapat memperoleh mutasi yang memodifikasi perilaku seluler, yang menyebabkan penurunan fungsional dalam homeostasis atau memberikan keunggulan kompetitif yang mengakibatkan pra-keganasan. Namun, frekuensi, dampak fenotipik, dan mekanisme yang mendasari mutagenesis spontan selama penuaan tidak jelas. Studi ini melaporkan dua mekanisme ketidakstabilan genom pada sel induk usus Drosophila dewasa (ISCs) yang menyebabkan perubahan fenotipik pada usus yang menua. Pertama, hilangnya heterozigositas yang sering ditemukan timbul dari rekombinasi homolog mitosis di ISC yang menghasilkan mosaik genetik. Kedua, delesi somatik dari sekuens DNA dan penataan ulang struktural yang besar, menyerupai yang dijelaskan pada kanker dan penyakit kongenital, sering mengakibatkan inaktivasi gen. Modifikasi semacam itu menginduksi inaktivasi somatik dari penekan tumor terkait-X Notch di ISC, yang mengarah ke neoplasia spontan pada pria tipe liar. Bersama-sama, temuan ini mengungkapkan modifikasi genom yang sering terjadi pada sel induk dewasa dan menunjukkan bahwa mosaik genetik somatik memiliki konsekuensi fungsional yang penting pada jaringan yang menua.

Rabu, 30 Desember

Nikhil, K.L., Vaze, K.M., Ratna, K. dan Sharma, V.K. (2015). Sifat jam sirkadian lalat buah Drosophila melanogaster menunjukkan kronotipe kemunculan awal dan akhir. Chronobiol Int [Epub sebelum dicetak]. ID PubMed: 26654995
Ringkasan:
Peran jam sirkadian dalam mengatur waktu perilaku sehari-hari diakui secara luas, dan sementara bukti empiris menunjukkan bahwa periode jam berkorelasi dengan fase yang disukai dari perilaku berirama (kronotipe), sifat jam lainnya juga telah dihipotesiskan untuk mendasari variasi kronotipe. Studi ini melaporkan bahwa lalat buah Drosophila melanogaster populasi yang menunjukkan kronotipe kemunculan malam (terlambat) dicirikan oleh insiden aritmisitas perilaku yang lebih tinggi dalam cahaya redup yang konstan, rentang entrainment yang lebih luas, penurunan tingkat re-entrainment ke jet-lag yang disimulasikan dan amplitudo yang lebih tinggi dari ritme entrained dan free-running dibandingkan untuk mereka yang menunjukkan kronotipe kemunculan pagi (awal). Hasil ini dengan demikian menyoroti peran sifat jam sirkadian seperti sensitivitas zeitgeber, amplitudo, dan kopling dalam mendorong variasi kronotipe.

Beatus, T., Guckenheimer, J. M. dan Cohen, I. (2015). Mengontrol gangguan gulungan pada lalat buah. J R Soc Interface 12 [Epub sebelum dicetak]. ID PubMed: 25762650
Ringkasan:
Karena ketidakstabilan aerodinamis, penerbangan mengepak yang stabil membutuhkan tindakan korektif cepat yang selalu ada. Studi ini menyelidiki bagaimana lalat mengendalikan gangguan di sepanjang sudut gulungan tubuh mereka, yang tidak stabil dan tingkat kebebasan mereka yang paling sensitif. Sebuah magnet direkatkan ke setiap lalat, dan pulsa magnetik pendek diterapkan yang menggulungnya di udara. Video cepat menunjukkan lalat memperbaiki gangguan hingga 100 derajat dalam waktu 30 +/- 7 ms dengan menerapkan asimetri amplitudo stroke yang dijelaskan dengan baik oleh pengontrol proporsional-integral linier. Untuk gangguan yang lebih agresif, bukti ditunjukkan untuk mekanisme kontrol nonlinier dan hierarkis. Lalat merespons gangguan gulungan dalam waktu 5 mdtk, menjadikan refleks koreksi ini salah satu yang tercepat di dunia hewan.

Davies, A., Louis, M. dan Webb, B. (2015) . Model Kemotaksis Larva Drosophila. PLoS Comput Biol 11: e1004606. ID PubMed: 26600460
Ringkasan:
Pengamatan rinci larva Drosophila chemotaxis telah mengkarakterisasi hubungan antara gradien bau dan run, head cast dan turn yang dibuat oleh hewan. Studi ini menggunakan model komputasi untuk menguji apakah mekanisme kontrol sensorimotor yang dihipotesiskan cukup untuk menjelaskan perilaku larva. Model ini menggabungkan tiga mekanisme berdasarkan transformasi sederhana dari sejarah terbaru intensitas bau di lokasi kepala. Yang pertama adalah peningkatan kemungkinan penghentian run sebagai respons terhadap penurunan konsentrasi secara bertahap, yang kedua peningkatan kemungkinan penghentian head cast sebagai respons terhadap peningkatan konsentrasi yang cepat, dan yang ketiga bias arah run ke atas gradien konsentrasi melalui modulasi head cast kecil. Model ini dapat disetel untuk menghasilkan statistik perilaku yang sebanding dengan yang dilaporkan untuk larva, dan penyetelan ini menghasilkan kinerja kemotaksis yang serupa dengan larva. Setiap mekanisme dapat didemonstrasikan untuk memungkinkan pendekatan bau, tetapi kombinasi mekanisme adalah yang paling efektif. Bagaimana mekanisme kontrol tingkat rendah ini berhubungan dengan ukuran perilaku seperti indeks preferensi digunakan untuk menyelidiki perilaku belajar larva dalam pengujian kelompok.

Selasa, 29 Desember

Sturgeon, M., Davis, D., Albers, A., Beatty, D., Austin, R., Ferguson, M., Tounsel, B. dan Liebl, F. L. (2015) . Ligase Notch E3 ligase, Mind Bomb1, mengatur lokalisasi reseptor glutamat di Drosophila. Sel Mol Neurosci 70:11-21. ID PubMed: 26596173
Ringkasan:
Kepadatan postsinaptik (PSD) adalah jaringan kaya protein yang penting untuk lokalisasi reseptor glutamat pascasinaps (GluRs) dan untuk sinyal hilir reseptor ini. Meskipun ratusan protein PSD telah diidentifikasi, banyak yang secara fungsional tidak dikarakterisasi. Sebuah layar genetik terbalik untuk mutasi yang mempengaruhi lokalisasi GluR dilakukan dengan menggunakan gen Drosophila yang mengkode homolog protein PSD mamalia. 42,8% dari mutan yang dianalisis menunjukkan perubahan signifikan dalam lokalisasi GluR di persimpangan neuromuskular larva instar ketiga (NMJ), sebuah model sinaps yang mengekspresikan homolog reseptor AMPA. Ligase ubiquitin E3, Mib1, yang mempromosikan pensinyalan Notch, diidentifikasi sebagai pengatur lokalisasi GluR sinaptik. Mib1 secara positif mengatur lokalisasi subunit GluR GluRIIA, GluRIIB, dan GluRIIC. Mutasi di mib1 dan ekspresi Mib1 di mana-mana yang tidak memiliki aktivitas ligase ubiquitin mengakibatkan hilangnya reseptor yang mengandung GluRIIA sinaptik. Sebaliknya, ekspresi berlebihan Mib1 di semua jaringan meningkatkan kadar GluRIIA pascasinaps. Tingkat seluler Mib1 juga penting untuk struktur neuron motorik presinaptik. Sementara pensinyalan Mib1 yang kurang menyebabkan pertumbuhan berlebih dari NMJ, ekspresi berlebihan Mib1 di mana-mana menghasilkan pengurangan jumlah bouton dan cabang neuron motorik prasinaptik. Perubahan sinaptik ini mungkin sekunder untuk pelepasan glutamat yang dilemahkan dari neuron motorik presinaptik di mib1 mutan sebagai mib1 mutan menunjukkan pengurangan yang signifikan dalam protein vesikel terkait protein string sistein dan frekuensi neurotransmisi spontan.

Xu, Y. dan Wang, T. (2015). CULD diperlukan untuk perdagangan endositik saluran rhodopsin dan TRPL dan kelangsungan hidup sel fotoreseptor. J Cell Sci [Epub sebelum dicetak]. ID PubMed: 26598556
Ringkasan:
Endositosis reseptor berpasangan G-protein (GPCRs) dan saluran terkait berkontribusi pada desensitisasi dan adaptasi berbagai kaskade pensinyalan. Di Drosophila, rhodopsin penginderaan cahaya utama, Rh1, dan saluran ion hilir, Transient Receptor Potential Like (TRPL), diendositosis sebagai respons terhadap cahaya, tetapi mekanismenya tidak jelas. Menggunakan pendekatan RNA-Sequencing, penelitian ini menemukan CULD (CG17352), protein transmembran domain CUB dan LDLa yang diperkaya sel fotoreseptor yang diperlukan untuk perdagangan endositik Rh1 dan TRPL. CULD terlokalisasi pada vesikel endositik Rh1- atau TRPL-positif. Mutasi di tidak bisa mengakibatkan akumulasi Rh1 dan TRPL dalam vesikel endositik, dan mengganggu pergantian reguler Rh1 dan TRPL endositik. Selain itu, hilangnya CULD menginduksi degenerasi retina yang bergantung pada cahaya dan usia, dan penurunan kadar Rh1 tetapi tidak TRPL menekan degenerasi retina pada tidak bisa lalat mutan nol. Data ini menunjukkan bahwa CULD memainkan peran penting dalam pergantian endositik Rh1 dan TRPL, dan menunjukkan bahwa perdagangan endositik rhodopsin yang bergantung pada CULD diperlukan untuk menjaga integritas fotoreseptor.

Senin, 28 Desember

Zhang, F., Huang, ZX, Bao, H., Cong, F., Wang, H., Chai, PC, Xi, Y., Ge, W., Somers, WG, Yang, Y., Cai, Y .dan Yang, X. (2015). Aktivator fosfotirosil fosfatase memfasilitasi lokalisasi Miranda melalui defosforilasi dalam membagi neuroblas. Pengembangan [Epub sebelum dicetak]. ID PubMed: 26586222
Ringkasan:
Mekanisme penargetan basal kompleks Miranda (Mira) selama divisi asimetris neuroblas Drosophila (NBs) belum sepenuhnya dipahami. Studi ini telah mengidentifikasi Phosphotyrosyl Phosphatase Activator (PTPA) yang dilestarikan sebagai mediator baru untuk lokalisasi basal kompleks Mira di NB otak larva. Di dalam ptpa NBs, Mira tetap sitoplasma selama mitosis awal di mana lokalisasi basalnya tertunda hingga anafase. Analisis terperinci menunjukkan bahwa PTPA bertindak secara independen dari, dan sebelum, aktivitas aPKC untuk melokalisasi Mira. Secara mekanis, data menunjukkan bahwa status fosforilasi residu Thr591 (T591) menentukan lokalisasi subseluler Mira dan bahwa PTPA memfasilitasi defosforilasi T591. Selanjutnya, PTPA berasosiasi dengan kompleks Protein Phosphatase 4 untuk memediasi lokalisasi Mira. Berdasarkan hasil ini, proses dua langkah untuk lokalisasi basal Mira selama divisi NB terungkap di mana asosiasi kortikal yang dimediasi PTPA/PP4 diikuti oleh restriksi basal yang dimediasi aPKC apikal.

Vagnoni, A., Hoffmann, P. C. dan Bullock, S. L. (2015) . Mengurangi tingkat Lissencephaly-1 menambah transportasi mitokondria dan memiliki efek perlindungan pada neuron Drosophila dewasa. J Cell Sci [Epub sebelum dicetak]. ID PubMed: 26598558
Ringkasan:
Transportasi mitokondria yang rusak di akson terlibat dalam patogenesis beberapa penyakit neurodegeneratif terkait usia. Namun, regulasi dan fungsi motilitas mitokondria aksonal selama penuaan normal kurang dipahami.Penelitian ini menggunakan prosedur pencitraan baru untuk mengkarakterisasi transportasi aksonal organel ini pada saraf sayap Drosophila dewasa. Selama kehidupan dewasa awal ada peningkatan dan penurunan progresif dalam proporsi mitokondria yang motil, yang bukan karena perubahan umum dalam transportasi kargo. Penghambatan eksperimental transpor mitokondria khususnya di masa dewasa mempercepat munculnya akumulasi protein fokal pada akson yang menua, menunjukkan cacat pada homeostasis protein. Tanpa diduga, menurunkan kadar Lissencephaly-1 (Lis1), co-faktor motor dynein, menambah transportasi mitokondria aksonal pada neuron sayap yang menua. Lis1 mutasi menekan akumulasi protein fokal pada neuron yang menua, termasuk yang disebabkan oleh gangguan pada mesin transportasi mitokondria. Data ini memberikan wawasan baru tentang dinamika motilitas mitokondria pada neuron dewasa in vivo, mengidentifikasi Lis1 sebagai pengatur negatif transportasi organel ini dan memberikan bukti hubungan antara gerakan mitokondria dan homeostasis protein neuron.

Minggu, 27 Desember

Acevedo, S. F., Peru, Y. C. d. P. R. L., Gonzalez, D. A., Rodan, A. R. dan Rothenfluh, A. (2015) . S6 kinase mencerminkan dan mengatur sedasi yang diinduksi etanol. J Neurosci 35: 15396-15402. ID PubMed: 26586826
Ringkasan:
Individu yang berisiko mengalami Gangguan Penggunaan Alkohol (AUD) sensitif terhadap efek ganjaran alkohol dan/atau resisten terhadap efek permusuhan dan penenangnya. Dasar molekuler untuk sifat-sifat ini kurang dipahami. Studi ini menunjukkan bahwa p70 S6 kinase (S6k), yang bekerja di bagian hilir reseptor insulin (InR) dan GTPase Arf6 kecil, adalah mediator kunci dari sedasi yang diinduksi etanol di Drosophila. Pensinyalan S6k dalam sistem saraf orang dewasa menentukan sensitivitas lalat terhadap sedasi. Selanjutnya, aktivitas S6k, diukur melalui tingkat fosforilasi (P-S6k), adalah penanda molekuler untuk sedasi dan aktivitas saraf secara keseluruhan: Tingkat P-S6k menurun ketika neuron dibungkam, serta setelah sedasi etanol akut. Sebaliknya, tingkat P-S6k rebound setelah pemulihan dari sedasi dan meningkat ketika aktivitas saraf ditingkatkan. Mengurangi aktivitas saraf meningkatkan sensitivitas terhadap sedasi yang diinduksi etanol, sedangkan aktivasi saraf menurunkan sensitivitas etanol. Data ini menunjukkan bahwa etanol memiliki efek pembungkaman akut pada aktivitas neuron dewasa, yang menekan pensinyalan InR/Arf6/S6k dan menghasilkan sedasi perilaku. Selain itu, aktivitas pensinyalan InR/Arf6/S6k ditunjukkan untuk menentukan sensitivitas perilaku lalat terhadap sedasi yang diinduksi etanol, menyoroti jalur ini dalam respons akut terhadap etanol.

Gonzales, E. D., Tanenhaus, A. K., Zhang, J., Chaffee, R. P. dan Yin, J. C. (2015) . Defek tidur dini pada model Drosophila dari Penyakit Huntington mencerminkan perubahan Pensinyalan PKA/CREB. Hum Mol Genet [Epub sebelum dicetak]. ID PubMed: 26604145
Ringkasan:
Penyakit Huntington (HD) adalah gangguan neurologis progresif yang gejala non-motoriknya termasuk gangguan tidur. Apakah kelainan tidur dan aktivitas merupakan gangguan molekuler utama ekspresi Huntingtin (mutHtt) mutan atau akibat dari degenerasi saraf masih belum jelas. Studi ini melaporkan bahwa model HD Drosophila menunjukkan gangguan tidur dan aktivitas sangat awal di masa dewasa, segera setelah pola tidur berkembang. Ekspresi pan-neuronal dari mutHtt full-length atau N-terminal terpotong merekapitulasi fenotipe tidur pasien HD: gangguan inisiasi tidur, tidur terfragmentasi dan berkurang, dan hiperaktif malam hari. Kurang tidur lalat model HD menghasilkan defisit tidur yang diperburuk, menunjukkan bahwa regulasi homeostatis tidur terganggu. Peningkatan aktivitas PKA/CREB pada lalat sehat menghasilkan pola tidur dan aktivitas yang serupa dengan model HD. Ditanyakan apakah penyimpangan dalam pensinyalan PKA/CREB bertanggung jawab atas fenotipe tidur/aktivitas onset dini ini. Penurunan pensinyalan melalui jalur cAMP/PKA terbukti menekan kematian perkembangan yang diinduksi mutHtt. Pengurangan PKA secara genetik menghilangkan defisit tidur/aktivitas pada lalat model HD, memulihkan respons homeostatik, dan memperpanjang umur rata-rata. Reporter in vivo, bagaimanapun, menunjukkan aktivitas dCREB2 tidak berubah, atau menurun ketika pola tidur/aktivitas abnormal, menunjukkan disosiasi PKA dan dCREB2 terjadi di awal patogenesis. Secara kolektif, data ini menunjukkan bahwa defek tidur mungkin mencerminkan proses patologis primer pada HD, dan bahwa pengukuran tidur dan cAMP/PKA dapat menjadi indikator prodromal penyakit, dan berfungsi sebagai target terapeutik untuk intervensi.

Sabtu, 26 Desember

Philip, P., Boija, A., Vaid, R., Churcher, A. M., Meyers, D. J., Cole, P. A., Mannervik, M. dan Stenberg, P. (2015) . Pengikatan CBP di luar promotor dan penambah di Drosophila melanogaster. Epigenetics Chromatin 8: 48. PubMed ID: 26604986
Ringkasan:
Protein pengikat CREB (CBP, juga dikenal sebagai nejire) adalah co-aktivator transkripsi yang dilestarikan dalam metazoa. CBP dan protein p300 terkait telah digunakan untuk memprediksi penambah ketika terjadi dengan monometilasi histon H3 pada lisin 4 (H3K4me1). Studi ini menunjukkan bahwa CBP terikat di situs genom dengan berbagai fungsi. Seperti yang diharapkan, CBP terikat pada promotor dan penambah aktif. Selain itu, situs CBP terkuat dalam genom ditemukan di elemen respons Polycomb yang tertanam dalam kromatin histone H3 lisin 27 trimetilasi (H3K27me3), di mana mereka berkorelasi dengan pengikatan kompleks represif Pho. CBP juga mengikat sebagian besar isolator dalam genom. Pada subset ini, CBP dapat mengatur aktivitas isolasi, diukur sebagai kemampuan untuk mencegah metilasi H3K27 represif menyebar ke kromatin yang berdekatan. Disimpulkan bahwa CBP dapat terlibat dalam represi Polycomb dan aktivitas isolator. CBP di semua elemen fungsional mungkin untuk mengatur interaksi antara daerah kromosom yang jauh, dan diperkirakan bahwa CBP mengendalikan organisasi kromatin tingkat tinggi.

Stampfel, G., Kazmar, T., Frank, O., Wienerroither, S., Reiter, F. dan Stark, A. (2015) . Regulator transkripsi membentuk kelompok yang beragam dengan fungsi regulasi yang bergantung pada konteks. Alam 528(7580)::147-51. ID PubMed: 26550828
Ringkasan:
Salah satu pertanyaan terpenting dalam biologi adalah bagaimana faktor transkripsi (TF) dan kofaktor mengontrol fungsi penambah dan dengan demikian ekspresi gen. Aktivasi penambah biasanya memerlukan kombinasi beberapa TF, yang menunjukkan bahwa TF berfungsi secara sinergis dan kombinatorial. Namun, sementara pengikatan TF telah dipelajari secara ekstensif, sedikit yang diketahui tentang bagaimana kombinasi TF dan kofaktor mengontrol fungsi penambah setelah mereka terikat. Biasanya tidak jelas TF mana yang berpartisipasi dalam aktivasi penambah kombinatorial, apakah TF yang berbeda membentuk kelompok yang berbeda secara fungsional, atau jika TF tertentu dapat saling menggantikan dalam konteks penambah yang ditentukan. Studi ini menilai kontribusi regulasi potensial dari TF dan kofaktor untuk kontrol penambah kombinatorial dengan uji pelengkap penambah. Fusi domain pengikatan-DNA GAL4 dari 812 TF Drosophila dan kofaktor direkrut ke 24 konteks penambah, dan aktivitas penambah diukur dengan 82.752 uji luciferase dalam sel S2. Sebagian besar faktor berfungsi dalam setidaknya satu konteks, namun kontribusinya berbeda antar konteks dan bervariasi dari represi hingga aktivasi (hingga 289 kali lipat) untuk faktor individu. Berdasarkan kesamaan fungsional di seluruh konteks, 15 kelompok TF didefinisikan yang berbeda dalam fungsi perkembangan dan fitur urutan protein. TF serupa dapat saling menggantikan, memungkinkan rekayasa ulang penambah dengan bertukar motif TF, dan pasangan kofaktor TF bekerja sama selama kontrol penambah dan berinteraksi secara fisik. Secara keseluruhan, penelitian ini menunjukkan bahwa aktivator dan represor dapat memiliki beragam fungsi pengaturan yang biasanya bergantung pada konteks penambah. Karakterisasi fungsional sistematis TF dan kofaktor harus lebih memahami kontrol penambah kombinatorial dan regulasi gen.

Jumat, 25 Desember

Dembeck, L. M., Boroczky, K., Huang, W., Schal, C., Anholt, R. R. dan Mackay, T. F. (2015) . Arsitektur genetik variasi alami dalam komposisi hidrokarbon kutikula di Drosophila. Elife 4 [Epub sebelum dicetak]. ID PubMed: 26568309
Ringkasan:
Hidrokarbon kutikula serangga (CHCs) mencegah pengeringan dan berfungsi sebagai sinyal kimia yang memediasi interaksi sosial. CHC Drosophila telah dipelajari secara ekstensif, tetapi dasar genetik untuk variasi individu dalam komposisi CHC sebagian besar tidak diketahui. Studi ini mengukur variasi dalam profil CHC di Panel Referensi Genetik D. melanogaster (DGRP) dan mengidentifikasi CHC baru. Analisis komponen utama (PC) digunakan untuk mengekstraksi PC yang menjelaskan sebagian besar variasi CHC dan mengidentifikasi polimorfisme di atau dekat 305 dan 173 gen pada wanita dan pria, masing-masing, terkait dengan variasi pada PC ini. Selain itu, 17 galur DGRP mengandung karakteristik alel Desat2 fungsional dari betina D. melanogaster Afrika dan Karibia (lebih banyak 5,9-C27:2 dan lebih sedikit 7,11-C27:2, isomer feromon seks betina). Gangguan ekspresi 24 gen kandidat mempengaruhi komposisi CHC setidaknya pada satu jenis kelamin. Gen-gen ini terkait dengan metabolisme asam lemak dan mewakili target mekanistik untuk variasi individu dalam komposisi CHC.

Vedelek, B., Blastyak, A. dan Boros, I. M. (2015). Interaksi lintas spesies antara protein Drosophila spesifik telomer yang berkembang pesat. PLoS One 10: e0142771. ID PubMed: 26566042
Ringkasan:
Integritas telomer di Drosophila melanogaster dipertahankan oleh kompleks multisubunit diduga disebut terminin yang diyakini bertindak dalam analogi dengan kompleks shelterin mamalia dalam melindungi ujung kromosom agar tidak dikenali sebagai situs kerusakan DNA. Lima protein yang seharusnya membentuk kompleks terminin adalah protein terkait HP1-ORC (HOAP), protein interaksi HP1-HOAP (HipHop), Verrocchio, Drosophila Telomere Loss/Modigliani dan Heterochromatic Protein 1. Empat dari protein ini berkembang pesat dalam genus Drosophila . Evolusi komponen terminin yang dipercepat dapat menunjukkan keterlibatan protein ini dalam proses munculnya spesies baru, karena perbedaan yang dihasilkan dari protein terminin dapat mencegah pembentukan hibrida, sehingga mendorong spesiasi. Namun, terminin bukanlah entitas yang terbukti secara eksperimental, dan tidak ada studi biokimia yang dilakukan untuk menyelidiki perakitan dan aksinya secara rinci. Dimotivasi oleh fakta-fakta ini untuk memulai studi biokimia pada fungsi terminin, upaya dilakukan untuk menyusun kembali terminin dengan mengekspresikan subunitnya pada bakteri, dan kemungkinan peran bagian komponen terminin yang berkembang cepat dalam perakitan kompleks diselidiki. Hasil menyarankan pembentukan subkompleks stabil terminin, tetapi tidak dari seluruh kompleks in vitro. Ditemukan bahwa evolusi yang dipercepat terbatas pada daerah tertentu dari komponen terminin, dan bahwa perbedaan dari D. melanogaster Drosophila Telomere Loss dan protein D. yakuba Verrocchio tidak menghalangi interaksi stabil mereka.

Beck, E. A. dan Llopart, A. (2015). Seleksi positif yang meluas mendorong diferensiasi protein sentromer dalam subkelompok Drosophila melanogaster. Sci Rep 5: 17197. PubMed ID: 26603658
Ringkasan:
Evolusi cepat pengulangan satelit sentromer diperkirakan menyebabkan evolusi asam amino kompensasi dalam interaksi protein kinetokor terkait sentromer. Cid, protein yang memediasi interaksi kinetokor/sentromer, menunjukkan pergantian asam amino yang sangat tinggi. Evolusi cepat dari pengulangan satelit Cid dan sentromerik mengarah pada hipotesis bahwa evolusi kompensasi yang jelas dapat meluas ke mitra yang berinteraksi di kompleks Condensin I (yaitu, SMC2, SMC4, Cap-H, Cap-D2, dan Cap-G) dan HP1s . Mutasi missense pada protein ini sering mengakibatkan pembentukan sentromer yang tidak tepat dan segregasi kromosom yang menyimpang, sehingga seleksi untuk fungsi yang dipertahankan dan koevolusi di antara protein kompleks kemungkinan kuat. Studi ini melaporkan bukti evolusi yang cepat dan seleksi positif berulang dalam tujuh protein terkait sentromer pada spesies subkelompok melanogaster Drosophila, dan selanjutnya mendalilkan bahwa seleksi positif pada protein ini dapat menjadi hasil dari penggerak sentromer dan perubahan kompensasi, dengan protein kinetokor bersaing untuk memperebutkannya. pemasangan spindel yang optimal.

Kamis, 24 Desember

Bahl, A., Serbe, E., Meier, M., Ammer, G. dan Borst, A. (2015). Mekanisme saraf untuk Drosophila penglihatan kontras. Neuron [Epub sebelum dicetak]. ID PubMed: 26673659
Ringkasan:
Kontras spasial, perbedaan nilai luminansi yang berdekatan, memberikan informasi tentang objek, tekstur, dan gerakan serta mendukung beragam perilaku visual. Oleh karena itu, perhitungan kontras merupakan elemen penting dari pemrosesan visual. Mekanisme yang mendasarinya, bagaimanapun, kurang dipahami. Dalam psikofisika manusia, ilusi kontras adalah sarana untuk mengeksplorasi perhitungan semacam itu, tetapi manusia menawarkan akses eksperimental yang terbatas. Melalui eksperimen perilaku di Drosophila, penelitian ini menunjukkan bahwa lalat juga rentan terhadap ilusi kontras. Menggunakan teknik pembungkaman genetik, elektrofisiologi, dan pemodelan, mekanisme dan korelasi saraf yang mendasari perilaku dibedah. Hasil menunjukkan bahwa perhitungan kontras spasial melibatkan penghambatan lateral dalam jalur yang sama yang menghitung gerakan peningkatan pencahayaan (jalur ON). Namun lalat buta gerak, di mana neuron peka gerak hilir yang diperlukan untuk perilaku optomotor dibungkam, menunjukkan respons kontras yang sepenuhnya utuh. Sebagai kesimpulan, kontras spasial dan isyarat gerak pertama kali dihitung dengan tumpang tindih sirkuit saraf yang kemudian dimasukkan ke dalam aliran pemrosesan visual paralel.

Jeanne, J. M. dan Wilson, R. I. (2015) . Konvergensi, divergensi, dan konvergensi kembali dalam jaringan feedforward meningkatkan kecepatan dan akurasi saraf. Neuron 88: 1014-1026. ID PubMed: 26586183
Ringkasan:
Salah satu motif rangkaian kanonik yang diusulkan yang digunakan oleh otak adalah jaringan feedforward di mana sinyal paralel bertemu, menyimpang, dan berkumpul kembali. Studi ini menyelidiki jaringan dengan arsitektur ini dalam sistem penciuman Drosophila. Fokus ditempatkan pada glomerulus yang neuron reseptornya bertemu secara menyeluruh ke enam neuron proyeksi yang kemudian menyatu kembali ke neuron tingkat tinggi. Konvergensi dan rekonvergensi keempat ditemukan untuk meningkatkan kemampuan dekoder untuk mendeteksi stimulus berdasarkan rangkaian lonjakan neuron tunggal. Transformasi pertama menerapkan rata-rata, dan meningkatkan akurasi deteksi puncak tetapi tidak mempercepat transformasi kedua mengimplementasikan deteksi kebetulan, dan meningkatkan kecepatan tetapi tidak akurasi puncak. Dalam setiap kasus, waktu integrasi dan ambang batas sel postsinaptik dicocokkan dengan statistik rangkaian lonjakan konvergen.

Rabu, 23 Desember

Rudolf, K., Umetsu, D., Aliee, M., Sui, L., Julicher, F. dan Dahmann, C. (2015) . Perbedaan lokal dalam transduksi sinyal Hedgehog meningkatkan ketegangan ikatan sel mekanis dan bias interkalasi sel di sepanjang batas kompartemen anteroposterior Drosophila. Perkembangan 142: 3845-3858. ID PubMed: 26577205
Ringkasan:
Dalam cakram sayap Drosophila yang sedang berkembang, pemeliharaan batas kompartemen anteroposterior (AP) lurus melibatkan peningkatan lokal dalam ketegangan mekanis pada ikatan sel di sepanjang batas. Studi ini menunjukkan bahwa perbedaan lokal dalam aktivitas transduksi sinyal Hedgehog antara sel anterior dan posterior diperlukan dan cukup untuk meningkatkan ketegangan mekanis di sepanjang batas AP. Perbedaan dalam transduksi sinyal Hedgehog ini juga diperlukan untuk membiaskan penataan ulang sel selama interkalasi sel untuk menjaga karakteristik bentuk lurus dari batas AP. Selain itu, memutuskan ikatan sel di sepanjang batas AP tidak mengurangi ketegangan pada ikatan tetangga, menyiratkan bahwa ketegangan mekanis aktif diregulasi, ikatan sel demi ikatan sel. Akhirnya, perbedaan dalam ekspresi protein yang mengandung homeodomain Engrailed juga berkontribusi pada bentuk lurus dari batas AP, terlepas dari transduksi sinyal Hedgehog dan tanpa memodulasi ketegangan ikatan sel. Data ini mengungkapkan hubungan baru antara perbedaan lokal dalam transduksi sinyal Hedgehog dan peningkatan lokal dalam ketegangan mekanis aktif dari ikatan sel yang bias penataan ulang junctional. Bentuk skala besar dari batas AP muncul dari sinyal biokimia yang menginduksi pola tegangan aktif pada ikatan sel.

Bornstein, B., dkk. (2015). Pemangkasan akson perkembangan membutuhkan destabilisasi adhesi sel oleh pensinyalan JNK. Neuron 88: 926-940. ID PubMed: 26586184
Ringkasan:
Pemangkasan akson perkembangan sangat penting untuk kabel otak normal pada vertebrata dan invertebrata. Bagaimana pemangkasan akson terjadi in vivo tidak dipahami dengan baik. Dalam layar hilangnya fungsi mosaik, penelitian ini menemukan bahwa Bsk, Drosophila JNK, diperlukan untuk pemangkasan akson tubuh jamur & neuron gamma, tetapi bukan dendritnya. Dengan menggabungkan genetika in vivo, biokimia, dan mikroskop resolusi tinggi, penelitian ini menunjukkan bahwa mekanisme yang dibutuhkan Bsk untuk pemangkasan adalah melalui pengurangan tingkat membran molekul adhesi Fasciclin II (FasII), ortolog NCAM. Sebaliknya, ekspresi berlebih dari FasII cukup untuk menghambat pemangkasan akson. Akhirnya, penelitian ini menunjukkan bahwa ekspresi berlebihan molekul adhesi sel lainnya, bersama dengan pelemahan sinyal JNK yang lemah, sangat menghambat pemangkasan. Secara keseluruhan, penelitian ini mengungkap interaksi baru dan tak terduga antara jalur JNK dan adhesi sel dan menemukan bahwa destabilisasi adhesi sel diperlukan untuk pemangkasan yang efisien.

Selasa, 22 Desember

Suzuki, T., Takayama, R. dan Sato, M. (2015). tanpa mata/Pax6 mengontrol produksi sel glial di pusat visual Drosophila melanogaster. Dev Biol [Epub sebelum dicetak]. ID PubMed: 26670857
Ringkasan:
Pax6 dikenal sebagai faktor neurogenik dalam perkembangan sistem saraf pusat dan mengatur proliferasi sel progenitor neuron dan mendorong diferensiasi neuron. Selain neurogenesis, Pax6 juga terlibat dalam spesifikasi dan pematangan sel glial. Studi ini menunjukkan bahwa Eyeless (Ey), homolog Drosophila dari Pax6, mengatur produksi sel glial di otak. Di pusat visual lalat yang sedang berkembang, produksi neuron dan sel glial dikendalikan oleh faktor transkripsi temporal yang diekspresikan secara berurutan dalam neuroblas (NBs). Di antara mereka, NB dari jendela temporal terakhir menghasilkan sel glial seperti astrosit. Ey diekspresikan dengan kuat pada NB paruh baya, yang jendela temporalnya lebih awal dibandingkan dengan glia yang memproduksi NB yang lebih tua. Ekspresi Ey yang lemah juga terdeteksi pada NB yang memproduksi glia. Hasilnya menunjukkan bahwa ekspresi Ey pada NB paruh baya secara tidak langsung mengontrol gliogenesis dari NB tertua dengan mengatur faktor transkripsi temporal lainnya. Selain itu, ekspresi Ey yang lemah di NB dari jendela temporal terakhir dapat secara langsung mengontrol gliogenesis.Ey juga diekspresikan dalam neuron yang dihasilkan dari NB dari jendela temporal positif-Ey. Menariknya, ekspresi berlebihan neuron spesifik Ey menyebabkan peningkatan signifikan dalam sel glial yang menunjukkan bahwa ekspresi neuronal Ey juga dapat berkontribusi pada gliogenesis. Dengan demikian, regulasi yang bergantung pada Pax6 dari perkembangan glial seperti astrosit dilestarikan di seluruh kerajaan hewan.

Sanchez, C. G., Teixeira, F. K., Ceko, B., Preall, J. B., Zamparini, A. L., Seifert, J. R., Malone, C. D., Hannon, G. J. dan Lehmann, R. (2015) . Regulasi biogenesis ribosom dan sintesis protein mengontrol diferensiasi sel induk germline. Sel Induk Sel [Epub sebelum dicetak]. ID PubMed: 26669894
Ringkasan:
Jaringan regulasi yang kompleks mengatur perilaku sel punca dan kontribusinya terhadap pertumbuhan, perbaikan, dan homeostasis jaringan. Namun, pemahaman penuh tentang jaringan yang mengendalikan pembaruan dan diferensiasi sel induk belum terwujud. Untuk membedah jaringan-jaringan ini secara sistematis dan mengidentifikasi komponen-komponennya, penelitian ini melakukan layar RNAi in vivo lebar transkriptom yang tidak bias pada sel punca germline Drosophila betina (GSCs). Berdasarkan cacat seluler yang dicirikan, 646 gen yang diidentifikasi diklasifikasikan ke dalam kelompok fenotipik dan fungsional, dan satu set komprehensif diluncurkan dari jaringan yang mengatur pemeliharaan, kelangsungan hidup, dan diferensiasi GSC. Analisis ini mengungkapkan peran tak terduga untuk faktor perakitan ribosom dalam mengendalikan sitokinesis sel induk. Selain itu, data menunjukkan bahwa transisi dari pembaruan diri ke diferensiasi bergantung pada peningkatan biogenesis ribosom disertai dengan peningkatan sintesis protein. Secara kolektif, hasil ini merinci jaringan genetik luas yang mengontrol homeostasis sel induk dan menyoroti regulasi sintesis protein yang rumit selama diferensiasi.

Senin, 21 Desember

Doyen, C. M., Chalkley, G. E., Voets, O., Bezstarosti, K., Demmers, J. A., Moshkin, Y. M. dan Verrijzer, C. P. (2015) . Pendamping khusus testis dan remodeler kromatin ISWI memediasi pengemasan ulang genom ayah. Perwakilan Sel 13: 1310-1318. ID PubMed: 26549447
Ringkasan:
Selama spermatogenesis, genom ayah dikemas ulang menjadi struktur kromatin non-nukleosomal yang sangat padat. Analisis bioinformatika mengungkapkan bahwa protein kromatin sperma Drosophila dicirikan oleh motif yang terkait dengan kotak kelompok mobilitas tinggi (HMG), yang disebut kotak transkrip spesifik pria (MST)-HMG. MST77F adalah protein kotak MST-HMG yang membentuk komponen penting dari kromatin sperma. Deposisi MST77F ke genom ayah membutuhkan fungsi pendamping tNAP (CG5017, disebut milkah), protein NAP spesifik testis. MST77F, pada gilirannya, memungkinkan penggabungan yang stabil dari protamin MST35Ba dan MST35Bb ke dalam kromatin sperma. Setelah deposisi protein kotak MST-HMG, remodeler kromatin yang bergantung pada ATP ISWI memediasi organisasi kromatin sperma yang sesuai. Sebaliknya, pada fertilisasi, ISWI ibu menargetkan genom ayah dan mendorong pengemasan ulang menjadi kromatin nukleosomal yang terdekondensasi. Kegagalan transisi ini pada embrio mutan ISWI diikuti oleh defek mitosis, aneuploidi, dan pembelahan embrio haploid. Dengan demikian, ISWI memungkinkan transisi dua arah antara dua bentuk kromatin yang berbeda secara fundamental.

Nakagawa, T., Ikehara, T., Doiguchi, M., Imamura, Y., Higashi, M., Yoneda, M. dan Ito, T. (2015). . Enhancer of acetyltransferase Chameau (EACHm) adalah ko-aktivator transkripsional baru. PLoS One 10: e0142305. ID PubMed: 26555228
Ringkasan:
Asetilasi histon nukleosomal oleh beragam histone acetyltransferases (HAT) memainkan peran penting dalam banyak peristiwa seluler. Penemuan HAT baru dan faktor terkait HAT telah memberikan wawasan baru untuk memahami peran dan mekanisme asetilasi histon. Studi ini mengidentifikasi aktivitas asetilasi Histon H3 yang menonjol secara in vitro dan memurnikan aktivitasnya, menunjukkan bahwa ia terdiri dari MYST acetyltransferase Chameau dan Enhancer dari keluarga Acetyltransferase Chameau (EACHm CG13463). EAchm adalah protein asam bermuatan negatif yang menahan aspartat dan glutamat. Selanjutnya, Chameau dan EAchm merangsang transkripsi in vitro bersama-sama dengan faktor transkripsi umum yang dimurnikan. Selain itu, analisis RNA-seq sel Chameau KD dan EAChm KD S2 menunjukkan bahwa Chameau dan EAChm mengatur transkripsi gen umum in vivo. Hasil ini menunjukkan bahwa EAChm mengatur transkripsi gen dalam embrio Drosophila dengan meningkatkan aktivitas Acetyltransferase Chameau.

Minggu, 20 Desember

Goto, T., Sato, K., Sone, H., Koganezawa, M., Ito, H. dan Yamamoto, D. (2015) . Zeste menyetel waktu tindakan ecdysone dalam memicu degenerasi jaringan terprogram di Drosophila. J Neurogenet: 1-5. ID PubMed: 26577029
Ringkasan:
Pada tahap kepompong, tubuh lalat mengalami remodeling metamorf yang ekstensif, di mana kematian sel terprogram memainkan peran penting. Dua dari proses konstituen dalam remodeling ini dipelajari, degenerasi kelenjar ludah dan kerusakan otot eclosion, yang dipicu oleh peningkatan dan penurunan hormon steroid ecdysone yang bersirkulasi pada awal dan akhir metamorfosis, masing-masing. Knockdown dari semangat (z), sebuah gen yang mengkode protein pengikat DNA urutan-spesifik yang terlibat dalam transveksi, dalam sel kelenjar ludah memajukan inisiasi degenerasi mereka, sedangkan knockdown z di neuron menunda kerusakan otot. Knockdown gen ecdysone-inducible, E74, menghambat degenerasi kelenjar ludah dengan sedikit efek pada kerusakan otot eclosion. Diusulkan agar Zeste menyetel sensitivitas target ecdysone terhadap hormon ini untuk memastikan margin keamanan yang tinggi sehingga program kematian sel akan diaktifkan ketika titer ecdysone berada pada tingkat yang cukup tinggi yang dicapai hanya pada tahap yang ditentukan selama metamorfosis.

Hurd, T. R., Liang, F. X. dan Lehmann, R. (2015) . Curly mengkodekan Dual Oxidase, yang bekerja dengan Heme Peroxidase Curly Su untuk membentuk sayap Drosophila dewasa. PLoS Genet 11: e1005625. ID PubMed: 26587980
Ringkasan:
Keriting, dijelaskan hampir seabad yang lalu, adalah salah satu penanda yang paling sering digunakan dalam genetika Drosophila. Meskipun demikian, identitas molekuler Curly tetap tidak jelas. Studi ini menunjukkan bahwa mutasi Curly muncul pada gen oksidase ganda (duoks), yang mengkode spesies oksigen reaktif (ROS) yang menghasilkan NADPH oksidase. Menggunakan mutasi Curly dan interferensi RNA (RNAi), penelitian ini menunjukkan bahwa Duox secara mandiri menstabilkan sayap pada hari terakhir perkembangan kepompong. Melalui studi penekanan genetik, penelitian ini mengidentifikasi heme peroksidase baru, Curly Su (Cysu CG5873) yang bekerja dengan Duox untuk membentuk sayap. Analisis ultrastruktur menunjukkan bahwa Duox dan Cysu diperlukan di sayap untuk mengikat dan menempel pada permukaan kutikula punggung dan perut selama pematangannya. Di Drosophila, Duox terkenal karena perannya dalam membunuh patogen dengan menghasilkan ROS bakterisida. Pekerjaan ini menambah semakin banyak penelitian yang menunjukkan bahwa fungsi utama Duox lebih struktural, membantu membentuk struktur ekstraseluler dan kutikula dalam hubungannya dengan peroksidase.

Sabtu, 19 Desember

Im, S. H., Takle, K., Jo, J., Babcock, D. T., Ma, Z., Xiang, Y. dan Galko, M. J. (2015) . Tachykinin bertindak di hulu pensinyalan Hedgehog autokrin selama sensitisasi nosiseptif di Drosophila. Elife 4 [Epub sebelum dicetak]. ID PubMed: 26575288
Ringkasan:
Sinyal nyeri pada vertebrata dimodulasi oleh neuropeptida seperti Substance P (SP). Untuk menentukan apakah modulasi tersebut dilestarikan dan berpotensi mengungkap interaksi baru antara jalur pensinyalan nosiseptif, pensinyalan SP / Tachykinin dianalisis dalam model Drosophila dari hipersensitivitas nosiseptif yang diinduksi kerusakan jaringan. Knockdown spesifik jaringan dan analisis mutan genetik mengungkapkan bahwa reseptor mirip Tachykinin dan Tachykinin (DTKR99D) diperlukan untuk sensitisasi nosiseptif termal yang diinduksi kerusakan. Rekaman elektrofisiologis menunjukkan bahwa DTKR99D diperlukan dalam neuron sensorik nosiseptif untuk peningkatan frekuensi penembakan yang bergantung pada suhu pada kerusakan jaringan. Ekspresi berlebihan DTKR menyebabkan hipersensitivitas nosiseptif termal perilaku dan elektrofisiologis. Landak, pengatur utama sensitisasi nosiseptif lainnya, diproduksi oleh neuron sensorik nosiseptif setelah kerusakan jaringan. Anehnya, analisis epistasis genetik mengungkapkan bahwa fungsi DTKR adalah hulu dari sensitisasi yang bergantung pada Hedgehog pada neuron sensorik nosiseptif. Hasil ini menyoroti peran yang dilestarikan untuk pensinyalan Tachykinin dalam mengatur nosiseptif dan kekuatan Drosophila untuk diseksi genetik nosiseptif.

Ichinose, T., Aso, Y., Yamagata, N., Abe, A., Rubin, G. M. dan Tanimoto, H. (2015) . Sinyal hadiah dalam sirkuit berulang mendorong pembentukan memori jangka panjang yang menggugah selera. Elife 4 [Epub lebih dulu dicetak]. ID PubMed: 26573957
Ringkasan:
Sinyal dopamin memberi penghargaan pada otak hewan. Presentasi tunggal hadiah gula untuk Drosophila mengaktifkan subset berbeda dari neuron dopamin yang secara independen menginduksi ingatan penciuman jangka pendek dan jangka panjang (STM dan LTM, masing-masing). Studi ini menunjukkan bahwa sirkuit hadiah berulang mendasari pembentukan dan konsolidasi LTM. Sirkuit umpan balik ini terdiri dari satu kelas neuron dopamin pemberi sinyal hadiah (PAM-alpha1) yang memproyeksikan ke wilayah terbatas tubuh jamur (MB), dan tipe sel keluaran MB spesifik, MBON-&alpha1, yang dendritnya berarbor sama. kompartemen MB. Baik neuron MBON-&alpha1 dan PAM-&alpha1 diperlukan selama akuisisi dan konsolidasi LTM nafsu makan. MBON-&alpha1 tambahan memediasi pengambilan LTM, yang tergantung pada reseptor dopamin sinyal di MB & alpha & beta neuron. Hasil ini menunjukkan bahwa sinyal hadiah mengubah jejak memori yang baru lahir menjadi LTM yang stabil menggunakan sirkuit umpan balik dengan mengorbankan kekhususan memori.

Jumat, 18 Desember

Morozova, T. V., Huang, W., Berdoa, V. A., Whitham, T., Anholt, R. R. dan Mackay, T. F. (2015) . Polimorfisme pada gen perkembangan saraf awal memengaruhi variasi alami dalam sensitivitas alkohol pada Drosophila . dewasa. BMC Genomics 16: 865. PubMed ID: 26503115
Ringkasan:
Penyalahgunaan alkohol dan alkoholisme adalah masalah kesehatan masyarakat yang signifikan, tetapi dasar genetik untuk variasi individu dalam sensitivitas alkohol masih kurang dipahami. Analisis asosiasi luas genom dilakukan untuk sensitivitas alkohol menggunakan sekuens, garis bawaan dari Panel Referensi Genetik D. melanogaster (DGRP) bersama-sama dengan pemetaan QTL ekstrim dalam populasi intercross lanjutan yang berasal dari garis DGRP sensitif dan resisten. DGRP terbukti memiliki variasi genetik yang substansial untuk sensitivitas dan toleransi alkohol. 247 gen kandidat yang mempengaruhi sensitivitas alkohol diidentifikasi dalam DGRP atau populasi intercross lanjutan yang diturunkan dari DGRP, beberapa di antaranya memenuhi ambang signifikansi yang dikoreksi Bonferroni, sementara yang lain terjadi di antara gen kandidat teratas yang terkait dengan variasi sensitivitas alkohol dalam beberapa analisis. Di antaranya adalah gen kandidat yang terkait dengan perkembangan dan fungsi sistem saraf, termasuk beberapa gen dalam kluster Dopamin dekarboksilase (Ddc) yang terlibat dalam sintesis katekolamin. 58 gen ini membentuk jaringan interaksi genetik. Gen kandidat diverifikasi menggunakan analisis mutasi, gangguan gen yang ditargetkan melalui knock-down RNAi dan profil transkripsi. Dua pertiga dari gen kandidat telah terlibat dalam studi Drosophila, tikus, dan manusia sebelumnya tentang fenotipe terkait alkohol. Disimpulkan bahwa variasi individu dalam sensitivitas alkohol di Drosophila sangat poligenik dan sebagian ditentukan oleh variasi jalur pensinyalan yang dilestarikan secara evolusioner yang terkait dengan biosintesis neurotransmitter katekolamin dan perkembangan awal sistem saraf.

Hirabayashi, S. dan Cagan, R. L. (2015). Kinase yang diinduksi garam memediasi penginderaan nutrisi untuk menghubungkan gula makanan dan tumorigenesis di Drosophila. Elife 4 [Epub sebelum dicetak]. ID PubMed: 26573956
Ringkasan:
Bagaimana sel kanker merasakan dan mendorong pertumbuhan dalam kondisi nutrisi yang menguntungkan masih belum sepenuhnya dipahami. Studi epidemiologis telah menunjukkan bahwa obesitas merupakan faktor risiko untuk berbagai jenis kanker. Memberi Drosophila gula diet tinggi tidak hanya mengarahkan cacat metabolisme termasuk obesitas dan resistensi insulin organisme, tetapi juga mengubah sel yang diaktifkan Ras/Src menjadi tumor agresif. Studi ini menunjukkan bahwa sel yang diaktifkan Ras / Src sensitif terhadap gangguan di jalur pensinyalan Hippo. Bukti diberikan bahwa isyarat nutrisi mengaktifkan Salt-inducible kinase, yang mengarah ke downregulasi jalur Hippo dalam sel yang diaktifkan Ras / Src. Hasilnya adalah peningkatan pensinyalan tanpa sayap yang bergantung pada Yorkie, mediator utama yang mempromosikan tumorigenesis Ras/Src yang ditingkatkan dengan diet di lingkungan yang resisten terhadap insulin. Melalui mekanisme ini, sel yang diaktifkan Ras/Src diposisikan untuk merespons sinyal nutrisi secara efisien dan memastikan pertumbuhan tumor pada kondisi kaya nutrisi termasuk obesitas.

Qin, S., Yin, H., Yang, C., Dou, Y., Liu, Z., Zhang, P., Yu, H., Huang, Y., Feng, J., Hao, J., Hao, J., Deng, L., Yan, X., Dong, X., Zhao, Z., Jiang, T., Wang, HW, Luo, SJ dan Xie, C. (2015) . Sebuah biokompas protein magnetik. Nat Mater [Epub di depan cetak]. ID PubMed: 26569474
Ringkasan:
Gagasan bahwa hewan dapat mendeteksi medan magnet bumi pernah ditertawakan, tetapi sekarang sudah mapan. Namun sifat biologis dari fenomena magnetosening tersebut masih belum diketahui. Studi ini melaporkan reseptor magnetik diduga (Drosophila CG8198, di sini bernama MagR) dan kompleks protein seperti batang magnetosensing multimer, diidentifikasi oleh postulat teoritis dan skrining genom, dan divalidasi dengan metode seluler, biokimia, struktural dan biofisik. Kompleks penginderaan magnet terdiri dari magnetoreseptor diduga yang diidentifikasi dan kriptokrom fotoreseptor terkait magnetoresepsi yang diketahui (Cry), memiliki atribut sistem berbasis Cry dan besi, dan menunjukkan keselarasan spontan dalam medan magnet, termasuk Bumi. Kompleks protein semacam itu dapat membentuk dasar magnetoresepsi pada hewan, dan dapat menyebabkan aplikasi di berbagai bidang.

Jha, A. R., Zhou, D., Brown, C. D., Kreitman, M., Haddad, G. G. dan White, K. P. (2015) . Berbagi sinyal genetik adaptasi hipoksia di Drosophila dan populasi manusia di dataran tinggi. Mol Biol Evol [Epub depan cetak]. ID PubMed: 26576852
Ringkasan:
Kemampuan untuk menahan oksigen rendah (toleransi hipoksia) adalah sifat poligenik dan dilestarikan secara mekanis yang memiliki implikasi penting bagi kesehatan dan evolusi manusia. Namun, sedikit yang diketahui tentang keragaman mekanisme genetik yang terlibat dalam adaptasi hipoksia pada populasi yang berkembang. Penelitian ini menggunakan evolusi eksperimental dan sekuensing seluruh genom di Drosophila melanogaster untuk menyelidiki peran variasi alami dalam adaptasi terhadap hipoksia. Menggunakan model campuran linier umum, perbedaan frekuensi alel yang signifikan diidentifikasi antara tiga populasi toleran hipoksia yang berevolusi secara independen dan populasi kontrol normoksik untuk sekitar 3.800 polimorfisme nukleotida tunggal. Sekitar 50% dari varian ini berkerumun di 66 wilayah genom yang berbeda. Daerah ini mengandung gen yang diekspresikan secara berbeda antara populasi toleran hipoksia dan normoksia dan beberapa gen yang diekspresikan secara berbeda terkait dengan proses metabolisme. Gen tambahan yang terkait dengan pengembangan sistem pernapasan dan trakea terbuka juga menunjukkan bukti pemilihan arah. Knockdown yang dimediasi RNAi dari beberapa ekspresi gen kandidat secara signifikan meningkatkan kelangsungan hidup pada hipoksia berat Menggunakan data polimorfisme nukleotida tunggal genomewide dari empat populasi manusia dataran tinggi-Sherpa, Tibet, Ethiopia, dan Andes, beberapa ortolog manusia dari gen yang diseleksi pada lalat ditemukan juga kemungkinan berada di bawah seleksi positif di keempat populasi manusia dataran tinggi . Dengan demikian, hasil ini menunjukkan bahwa seleksi untuk toleransi hipoksia dapat bertindak pada variasi genetik yang berdiri pada gen dan jalur serupa yang ada pada organisme yang menyimpang ratusan juta tahun.

Kamis, 17 Desember

Rousso, T., Schejter, E.D. dan Shilo, B.Z. (2015). Rilis konten yang diatur dari Drosophila vesikel protein lem oleh jaringan kontraktil aktomiosin. Nat Cell Biol [Epub sebelum dicetak]. ID PubMed: 26641716
Ringkasan:
Melepaskan konten dari vesikel besar yang berdiameter beberapa mikrometer menimbulkan tantangan luar biasa bagi sistem sekretori. Jaringan aktomiosin biasanya melapisi vesikel-vesikel ini, dan dianggap memberikan kekuatan yang diperlukan untuk memediasi pelepasan muatan yang efisien. Penelitian ini menggambarkan dinamika spasial dan temporal dari pembentukan lapisan aktomiosin ini di sekitar vesikel besar dan kolaps vesikel yang dihasilkan, secara hidup. Drosophila melanogaster kelenjar ludah. Protein keluarga Formin Diaphanous (Dia) diidentifikasi sebagai nukleator aktin utama yang terlibat dalam menghasilkan struktur ini, dan Rho ditemukan sebagai integrator perakitan aktin dan aktivasi mesin kontraktil yang terdiri dari jaringan aktomiosin ini. Pencitraan resolusi tinggi mengungkapkan organisasi miosin II seperti sangkar yang unik pada lapisan aktin. Susunan miosin ini memerlukan polimerisasi aktin bercabang, dan sangat penting untuk mengerahkan gaya non-isotropik, yang memediasi kontraksi vesikel yang efisien.

Melkov, A., Simchoni, Y., Alcalay, Y. dan Abdu, U. (2015) . Organisasi mikrotubulus dinamis dan transportasi mitokondria diatur oleh jalur Kinesin-1 yang berbeda. Biol Open [Epub sebelum dicetak]. ID PubMed: 26581590
Ringkasan:
Mikrotubulus (MT) plus-end motor kinesin heavy chain (Khc) terkenal karena perannya dalam transportasi kargo jarak jauh. Bukti terbaru menunjukkan bahwa Khc juga diperlukan untuk organisasi jaringan MT seluler dengan memediasi geseran MT. Studi ini menemukan bahwa mutasi pada Khc dan gen protein adaptornya, kinesin light chain (Klc) menghasilkan cacat morfologi bulu yang identik, dengan bagian atas bulu menjadi lebih tipis dan rata dari biasanya dan gagal meruncing ke arah ujung bulu. Transportasi mitokondria bulu terbukti membutuhkan Khc tetapi bukan Klc sebagai kekuatan yang bersaing untuk dynein rantai berat (Dhc). Anehnya, Dhc terbukti menjadi motor utama untuk transportasi mitokondria cepat anterograde dan retrograde. Bagian atas bulu mutan Khc dan Klc tidak memiliki MTs yang stabil. Saat mengikuti polimerisasi MT dinamis melalui penggunaan protein pengikat akhir 1 (EB1) yang diberi tag GFP, dicatat bahwa pada ujung bulu mutan Khc dan Klc, MTs dinamis secara signifikan menyimpang dari sumbu pertumbuhan paralel bulu, relatif terhadap bulu tipe liar . GFP-EB1 gagal berkonsentrasi sebagai fokus di ujung bulu mutan Khc dan Klc. Diusulkan bahwa kegagalan bristle tapering disebabkan oleh cacat dalam mengarahkan MTs dinamis di ujung tumbuh.Dengan demikian, penelitian ini mengungkapkan fungsi baru untuk Khc dan Klc dalam mengarahkan MTs dinamis selama pertumbuhan sel terpolarisasi. Selain itu, penelitian ini telah menunjukkan mode koordinasi baru dalam transportasi mitokondria antara Khc dan Dhc.

Rabu, 16 Desember

Lee, D. M., Rodrigues, F. F., Yu, C. G., Swan, M. dan Harris, T. J. (2015) . Interaksi protein PH Domain-Arf G melokalisasi Steppke Arf-GEF untuk regulasi alur pembelahan di Drosophila. PLoS One 10: e0142562. ID PubMed: 26556630
Ringkasan:
Rekrutmen faktor pertukaran GDP/GTP (GEFs) ke situs subseluler spesifik menentukan di mana mereka mengaktifkan protein G kecil untuk regulasi berbagai proses seluler. Sitohesin adalah keluarga GEF membran plasma yang dilestarikan untuk protein G kecil Arf yang mengatur endositosis. Makalah ini melaporkan bagaimana domain pleckstrin homology (PH) dari Drosophila cytohesin Steppke mempengaruhi lokalisasi dan aktivitasnya pada alur pembelahan embrio awal. Domain PH diperlukan untuk lokalisasi alur Steppke, dan untuk mengatur struktur alur. Namun, domain PH tidak cukup untuk lokalisasi. Domain Steppke PH secara istimewa mengikat PIP3 in vitro melalui mekanisme yang dilestarikan. Namun, gangguan residu untuk pengikatan PIP3 tidak memiliki efek nyata pada lokalisasi dan efek GFP-Steppke. Sebaliknya, residu untuk mengikat protein Arf G yang terikat GTP memberikan kontribusi besar pada lokalisasi dan aktivitas Steppke ini. Arf1-GFP, Arf6-GFP dan Arl4-GFP dilokalkan ke alur. Namun, mungkin karena redundansi, sulit untuk menilai bagaimana protein G kecil Arf individu mempengaruhi Steppke. Meskipun demikian, data ini menunjukkan bahwa domain Steppke PH dan residunya yang dilestarikan untuk mengikat protein Arf G yang terikat GTP memiliki efek substansial pada lokalisasi dan aktivitas Steppke pada embrio Drosophila awal.

Giachello, C. N. dan Baines, R. A. (2015). Aktivitas saraf yang tidak tepat selama periode sensitif dalam embriogenesis menghasilkan perilaku seperti kejang yang persisten. Curr Biol 25: 2964-2968. ID PubMed: 26549258
Ringkasan:
Pematangan sirkuit saraf membutuhkan proses yang bergantung pada aktivitas yang mendukung munculnya perilaku yang sesuai pada orang dewasa. Telah diusulkan bahwa gangguan peristiwa ini, selama periode kritis tertentu ketika mereka memberikan pengaruh maksimal, dapat menyebabkan penyakit perkembangan saraf, termasuk epilepsi. Namun, kompleksitas sirkuit saraf, ditambah dengan kurangnya informasi tentang pembentukan jaringan pada mamalia, membuat sulit untuk menyelidiki hipotesis ini secara langsung. Model alternatif, termasuk lalat buah Drosophila melanogaster, menunjukkan kesamaan yang luar biasa antara aktivitas seperti kejang eksperimental dan fenotipe klinis. Secara khusus, sekelompok lalat, yang disebut mutan bang-sensitif (bs) telah banyak digunakan untuk menyelidiki mekanisme patofisiologis yang mendasari kejang. Fenotip kejang dapat diukur dalam tahap larva menggunakan uji kejut listrik, dan perilaku ini pada mutan bs berkurang secara dramatis setelah konsumsi obat anti-epilepsi tipikal (AED). Studi ini menjelaskan periode kritis perkembangan embrio di Drosophila selama manipulasi aktivitas saraf cukup untuk secara signifikan mempengaruhi perilaku kejang pada tahap postembrionik. Penghambatan aktivitas tinggi, karakteristik model kejang bs, selama periode kritis cukup untuk menekan kejang. Sebaliknya, peningkatan eksitasi neuron selama periode yang sama pada tipe liar (WT) cukup untuk menginduksi perilaku kejang secara permanen. Lebih lanjut, penelitian ini menunjukkan bahwa induksi kejang pada WT berkorelasi dengan perubahan fungsional input motoneuron yang merupakan karakteristik mutan bs. Induksi kejang diselamatkan dengan pemberian AED sebelumnya, membuka perspektif baru untuk intervensi obat awal dalam pengobatan epilepsi genetik.

Selasa, 15 Desember

Lin, T., dkk. (2015). Spindle-F adalah mediator sentral dari pemangkasan dendrit yang bergantung pada Ik2 kinase di neuron sensorik Drosophila. PLoS Genet 11: e1005642. ID PubMed: 26540204
Ringkasan:
Selama perkembangan, neuron sensorik Drosophila tertentu menjalani pemangkasan dendrit yang secara selektif menghilangkan dendritnya tetapi membiarkan akson tetap utuh. Bagaimana neuron ini mengatur aktivitas pemangkasan di dendrit masih belum diketahui. Penelitian ini mengidentifikasi protein coiled-coil Spindle-F (Spn-F) yang diperlukan untuk pemangkasan dendrit pada neuron sensorik Drosophila. Spn-F bertindak hilir kinase Ik2 terkait IKK di jalur yang sama untuk pemangkasan dendrit. Spn-F menunjukkan pola belang-belang pada neuron larva, sedangkan puncta Spn-F ini didistribusikan kembali dalam neuron pupa, suatu langkah yang penting untuk pemangkasan dendrit. Redistribusi Spn-F dari puncta di neuron kepompong membutuhkan fosforilasi Spn-F oleh Ik2 kinase untuk mengurangi asosiasi diri Spn-F, dan tergantung pada fungsi kompleks dynein motor mikrotubulus. Spn-F adalah komponen kunci untuk menghubungkan Ik2 kinase ke kompleks motor dynein, dan pembentukan kompleks Ik2/Spn-F/dynein sangat penting untuk redistribusi Spn-F dan untuk pemangkasan dendrit. Temuan ini mengungkapkan mekanisme pengaturan baru untuk pemangkasan dendrit yang dicapai dengan aktivasi temporal Ik2 kinase dan redistribusi kompleks Ik2/Spn-F yang dimediasi dynein dalam neuron.

Sitaraman, D., Aso, Y., Rubin, G.M. dan Nitabach, M.N. (2015). Kontrol tidur dengan input dopaminergik ke Drosophila tubuh jamur. Sirkuit Neural Depan 9: 73. PubMed ID: 26617493
Ringkasan:
NS Drosophila tubuh jamur (MB) adalah jaringan pembelajaran asosiatif yang penting untuk kontrol tidur. Kelas sel MB Kenyon (KC) intrinsik tertentu telah diidentifikasi yang mengatur tidur melalui aktivasi sinaptik neuron keluaran MB tertentu (MBON) yang aksonnya menyampaikan sinyal kontrol tidur dari MB ke daerah target hilir. Secara khusus, ditemukan bahwa KC yang mempromosikan tidur meningkatkan tidur dengan secara istimewa mengaktifkan MBON yang mempromosikan tidur kolinergik, sementara KC yang mempromosikan bangun mengurangi tidur dengan secara istimewa mengaktifkan MBON yang mempromosikan glutamatergik yang mempromosikan bangun. Dengan menggunakan kombinasi pendekatan genetik dan fisiologis untuk mengidentifikasi neuron dopaminergik yang merangsang bangun (DAN) yang menginervasi MB, ditunjukkan bahwa mereka mengaktifkan MBON yang mempromosikan bangun. Studi-studi ini mengungkapkan mekanisme kontrol tidur dopaminergik yang kemungkinan beroperasi dengan modulasi sirkuit mikro KC-MBON.

Senin, 14 Desember

Chen, C., Buhl, E., Xu, M., Croset, V., Rees, J. S., Lilley, K. S., Benton, R., Hodge, J. J. dan Stanesky, R. (2015) . Drosophila Ionotropic Receptor 25a memediasi pengaturan ulang jam sirkadian berdasarkan suhu. Alam 527: 516-520. ID PubMed: 26580016
Ringkasan:
Jam sirkadian adalah pengatur waktu endogen yang menyesuaikan perilaku dan fisiologi dengan hari matahari. Fotoreseptor visual dan non-visual bertanggung jawab untuk menyinkronkan jam sirkadian dengan cahaya, tetapi pengaturan ulang jam juga dicapai dengan mengganti suhu siang dan malam dengan perbedaan hanya 2-4 derajat C. Studi ini menunjukkan bahwa Drosophila Ionotropic Receptor 25a (IR25a) diperlukan untuk sinkronisasi perilaku ke siklus suhu amplitudo rendah. Saluran ini diekspresikan dalam neuron sensorik dari reseptor regangan internal yang sebelumnya terlibat dalam sinkronisasi suhu jam sirkadian. IR25a diperlukan untuk osilasi protein jam yang disinkronkan dengan suhu dalam himpunan bagian dari neuron jam pusat. Rekaman saraf kaki ekstraseluler mengungkapkan respons sensorik yang bergantung pada suhu dan IR25a, dan kesalahan ekspresi IR25a memberikan penembakan neuron heterolog yang bergantung pada suhu. Diusulkan bahwa IR25a adalah bagian dari jalur input ke jam sirkadian yang mendeteksi perbedaan suhu yang kecil. Jalur ini beroperasi tanpa adanya sensor 'panas' dan 'dingin' yang diketahui di antena Drosophila, mengungkapkan keberadaan saluran pensinyalan suhu perifer-ke-otak yang baru.

Kallman, B. R., Kim, H. dan Scott, K. (2015). Eksitasi dan penghambatan ke neuron pacaran pusat bias pilihan pasangan. Elife 4 [Epub sebelum dicetak]. ID PubMed: 26568316
Ringkasan:
Kemampuan untuk membedakan jantan dari betina sangat penting untuk pemilihan pasangan yang produktif dan perbanyakan spesies. Studi terbaru di Drosophila telah mengidentifikasi kelas yang berbeda dari neuron kemosensori kontak yang mendeteksi feromon wanita atau pria dan mempengaruhi keputusan pacaran. Studi ini meneliti jalur saraf pusat di otak pria yang memproses feromon wanita dan pria menggunakan studi anatomi, pencitraan kalsium, optogenetik, dan perilaku. Neuron sensorik ditemukan yang mendeteksi feromon wanita, tetapi bukan feromon pria, mengaktifkan kelas baru neuron di kabel saraf ventral untuk menyebabkan aktivasi neuron P1, neuron perintah khusus pria yang memicu pacaran. Selain itu, neuron sensorik yang mendeteksi feromon pria, serta yang mendeteksi feromon wanita, mengaktifkan neuron mAL pusat untuk menghambat P1. Studi-studi ini menunjukkan bahwa keseimbangan dorongan rangsang dan penghambatan ke neuron pusat yang mempromosikan pacaran mengontrol keputusan kawin.

Gardner, B., Strus, E., Meng, Q. C., Coradetti, T., Naidoo, N. N., Kelz, M. B. dan Williams, J. A. (2015) . Homeostasis tidur dan anestesi umum: Apakah lalat buah cukup istirahat setelah muncul dari Propofol?. Anestesiologi [Epub sebelum cetak]. ID PubMed: 26556728
Ringkasan:
Fitur neurofisiologis bersama antara tidur dan hipnosis yang diinduksi anestesi menunjukkan potensi tumpang tindih dalam sirkuit saraf yang mendasari kedua keadaan. Para penulis mengeksplorasi hipotesis bahwa anestesi propofol juga menghilangkan tekanan tidur pada lalat buah. Propofol diberikan dengan memindahkan lalat ke makanan yang mengandung berbagai dosis propofol. Kromatografi cair kinerja tinggi digunakan untuk mengukur konsentrasi jaringan dari propofol yang tertelan. Untuk menentukan apakah anestesi propofol menggantikan tidur alami, lalat menjadi sasaran kurang tidur 10 jam (SD), diikuti oleh paparan propofol 6 jam, dan dipantau untuk tidur berikutnya. Pengobatan propofol oral terbukti menyebabkan anestesi pada lalat seperti yang ditunjukkan oleh pengurangan tergantung dosis dalam aktivitas alat gerak dan peningkatan ambang gairah. Pemulihan tidur pada lalat yang diberi propofol setelah SD ditunda sampai lalat muncul dari anestesi. SD juga dikaitkan dengan peningkatan mortalitas yang signifikan pada lalat yang diberi propofol. Bersama-sama, data ini menunjukkan bahwa lalat buah dibius secara efektif dengan menelan propofol dan menunjukkan bahwa target molekuler dan neuronal propofol yang homolog dipertahankan di Drosophila. Namun, pengukuran perilaku menunjukkan bahwa anestesi propofol tidak memenuhi kebutuhan homeostatis untuk tidur dan dapat membahayakan sifat restoratif tidur.

Minggu, 13 Desember

Sansone, C. L., Cohen, J., Yasunaga, A., Xu, J., Osborn, G., Subramanian, H., Emas, B., Buchon, N. dan Cherry, S. (2015) . Priming yang bergantung pada mikrobiota dari kekebalan usus antivirus di Drosophila. Mikroba Inang Sel 18: 571-581. ID PubMed: 26567510
Ringkasan:
Patogen enterik harus mengatasi pertahanan usus untuk membangun infeksi. Di Drosophila, jalur pensinyalan ERK menghambat infeksi virus enterik. Mikroflora usus juga mempengaruhi kekebalan tetapi perannya dalam infeksi virus enterik tidak diketahui. Studi ini menunjukkan bahwa dua sinyal diperlukan untuk mengaktifkan pensinyalan ERK antivirus di epitel usus. Satu sinyal tergantung pada pengenalan peptidoglikan dari mikrobiota, terutama dari Acetobacter pomorum komensal, yang merupakan induksi yang bergantung pada NF-&kappaB dari faktor yang disekresikan, Pvf2. Namun, mikrobiota tidak cukup untuk menginduksi jalur ini, peristiwa pensinyalan yang dimulai virus kedua yang melibatkan pelepasan gen transkripsional yang dijeda yang dimediasi oleh kinase Cdk9 juga diperlukan untuk produksi Pvf2. Pvf2 merangsang kekebalan antivirus dengan mengikat reseptor tirosin kinase PVR, yang diperlukan dan cukup untuk respons ERK usus. Temuan ini menunjukkan bahwa penginderaan komensal spesifik memicu sinyal inflamasi yang diperlukan untuk respons epitel yang membatasi infeksi virus enterik.

Hiperkapnia, peningkatan tekanan parsial CO2 dalam darah dan jaringan, berkembang pada banyak pasien dengan penyakit paru obstruktif kronik berat dan gangguan paru lanjut lainnya. Pasien dengan penyakit lanjut sering mengembangkan infeksi paru-paru bakteri. Hiperkapnia telah terbukti menekan induksi gen respon imun bawaan yang diatur NF-&kappaB yang diperlukan untuk pertahanan inang, dan ini meningkatkan mortalitas akibat infeksi bakteri. Namun, mediator molekuler dari penekanan kekebalan hiperkapnia tidak ditentukan. Studi ini melaporkan layar interferensi RNA genome-wide dalam sel Drosophila S2* yang distimulasi dengan peptidoglikan bakteri. Layar mengidentifikasi 16 gen dengan ortolog manusia yang knockdownnya mengurangi penekanan hiperkapnik dari gen yang mengkodekan peptida antimikroba Diptericin (Dipt), tetapi tidak meningkatkan kadar mRNA Dipt di udara. Tes in vivo dari salah satu hit layar terkuat, homeodomain 2 jari seng (Zfh2 mamalia ortolog ZFHX3/ATBF1 dan ZFHX4), menunjukkan bahwa pengurangan zfh2 fungsi meningkatkan kelangsungan hidup lalat terkena CO2 tinggi dan terinfeksi Staphylococcus aureus. Knockdown khusus jaringan dari zfh2 dalam tubuh gemuk mengurangi penurunan Dipt yang diinduksi hiperkapnia dan meningkatkan ketahanan lalat yang terpapar CO2 terhadap infeksi. Mutasi Zfh2 juga sebagian menyelamatkan penundaan yang diinduksi hiperkapnia dalam penetasan telur, menunjukkan bahwa peran Zfh2 dalam memediasi respons terhadap hiperkapnia melampaui sistem kekebalan. Secara keseluruhan, hasil ini mengidentifikasi Zfh2 sebagai mediator in vivo pertama dari penekanan kekebalan hiperkapnik.

Gutzwiller, F., Carmo, C. R., Miller, D. E., Rice, D. W., Newton, I. L., Hawley, R. S., Teixeira, L. dan Bergman, C. M. (2015) . Dinamika ekspresi gen Wolbachia pipientis di seluruh siklus hidup Drosophila melanogaster. G3 (Bethesda) [Epub sebelum dicetak]. ID PubMed: 26497146
Ringkasan:
Interaksi simbiosis antara mikroba dan inang multiselulernya memiliki konsekuensi biologis yang berlipat ganda. Untuk lebih memahami bagaimana bakteri mempertahankan asosiasi simbiosis dengan inang hewan, penelitian ini menganalisis ekspresi gen di seluruh genom untuk endosimbiotik alpha-proteobacteria Wolbachia pipientis di seluruh siklus hidup Drosophila. Mayoritas gen Wolbachia diekspresikan secara stabil di seluruh siklus hidup D. melanogaster, tetapi 7,8% gen Wolbachia menunjukkan perbedaan ekspresi spesifik tahap atau jenis kelamin yang kuat ketika dipelajari dalam konteks seluruh organisme. Gen Wolbachia yang diekspresikan secara berbeda biasanya diatur ke atas setelah embriogenesis Drosophila dan mencakup banyak membran bakteri, sistem sekresi, dan protein yang mengandung ankyrin-repeat. Gen bias-seks sering diatur sebagai operon kecil dari gen yang tidak dicirikan dan terutama diatur ke atas pada laki-laki Drosophila dewasa dengan cara yang bergantung pada usia. Tingkat ekspresi gen kandidat yang dilaporkan sebelumnya yang dianggap terlibat dalam interaksi inang-mikroba diselidiki secara sistematis, termasuk yang ada di profag WO-A dan WO-B dan di wilayah Octomom yang telah terlibat dalam mengatur titer bakteri dan patogenisitas. Karya ini memberikan wawasan komprehensif tentang dinamika perkembangan ekspresi gen untuk endosimbion yang tersebar luas dalam konteks inang alaminya, dan menunjukkan bahwa data ekspresi gen publik menyimpan sumber daya yang kaya untuk menyelidiki dasar fungsional simbiosis Wolbachia-Drosophila dan membubuhi keterangan output transkripsi dari genom Wolbachia.

Sabtu, 12 Desember

Bergland, A. O., Tobler, R., Gonzalez, J., Schmidt, P. dan Petrov, D. (2015). Kontak sekunder dan adaptasi lokal berkontribusi pada pola lebar genom dari variasi klinis Drosophila melanogaster. Mol Ecol [Epub sebelum dicetak]. ID PubMed: 26547394
Ringkasan:
Populasi tersusun di sepanjang gradien garis lintang yang luas sering menunjukkan pola variasi klinis dalam fenotipe dan genotipe. Diferensiasi populasi tersebut dapat dihasilkan dan dipertahankan oleh peristiwa demografis historis dan adaptasi lokal. Kekuatan evolusioner ini tidak saling eksklusif dan dalam beberapa kasus dapat menghasilkan pola diferensiasi genetik yang hampir identik di antara populasi. Studi ini menyelidiki kekuatan evolusi yang menghasilkan dan mempertahankan variasi klinal genom-lebar di antara populasi sampel Drosophila melanogaster di Amerika Utara dan Australia. Pola variasi klinis di benua ini dikontraskan dengan pola diferensiasi antara populasi leluhur Eropa dan Afrika. Menggunakan metode mapan dan baru yang diturunkan dalam penelitian ini, ditunjukkan bahwa populasi Amerika Utara dan Australia yang baru-baru ini diturunkan kemungkinan didirikan oleh garis keturunan Eropa dan Afrika dan bahwa peristiwa hibridisasi ini kemungkinan berkontribusi pada pola genom lebar variasi klinal paralel antar benua. Efek pervasif dari pencampuran berarti bahwa diferensiasi hanya pada beberapa ratus lokus dapat dikaitkan dengan operasi pemilihan yang bervariasi secara spasial menggunakan pendekatan outlier FST. Hasil ini memberikan wawasan baru ke dalam sistem diferensiasi klinis yang dipelajari dengan baik di D. melanogaster dan memberikan konteks untuk penelitian di masa depan yang berusaha mengidentifikasi lokus yang berkontribusi pada adaptasi lokal dalam berbagai organisme, termasuk spesies invasif lainnya serta endemik beriklim sedang.

Kain, J. S., Zhang, S., Akhund-Zade, J., Samuel, A. D., Klein, M. dan de Bivort, B. L. (2015) . Variabilitas dalam preferensi termal dan fototaktik di Drosophila mungkin mencerminkan strategi lindung nilai taruhan adaptif. Evolusi [Epub di depan cetak]. ID PubMed: 26531165
Ringkasan:
Organisme menggunakan berbagai strategi untuk mengatasi kondisi lingkungan yang berfluktuasi. Dalam lindung nilai taruhan yang terdiversifikasi, satu genotipe menunjukkan heterogenitas fenotipik dengan harapan bahwa beberapa individu akan bertahan dari tekanan selektif sementara. Sampai saat ini, bukti empiris untuk lindung nilai taruhan langka. Studi ini mengamati bahwa lalat individu Drosophila melanogaster menunjukkan variasi mencolok dalam perilaku preferensi cahaya dan suhu. Dengan pendekatan pemodelan yang menggabungkan data cuaca dan iklim dunia nyata untuk mensimulasikan kelangsungan hidup dan reproduksi yang bergantung pada preferensi suhu, penelitian ini menemukan bahwa strategi lindung nilai taruhan dapat mendasari keragaman perilaku antar-individu yang diamati. Secara khusus, strategi lindung nilai taruhan mengalahkan strategi di mana preferensi termal individu dapat diwariskan. Hewan yang menggunakan lindung nilai taruhan menahan diri dari beradaptasi dengan kesejukan musim semi dengan peningkatan pencarian hangat yang pasti menjadi kontraproduktif di musim panas. Strategi ini sangat berharga ketika suhu musiman rata-rata khas, atau ketika ada fluktuasi suhu yang cukup besar dalam musim. Model memprediksi, dan dan penelitian ini diverifikasi secara eksperimental, bahwa perilaku lalat individu tidak diwariskan. Akhirnya, efek dari data cuaca historis, perubahan iklim, dan variasi musiman geografis pada strategi optimal yang mendasari variasi perilaku antar individu dimodelkan, mencirikan rezim di mana lindung nilai taruhan menguntungkan.

Yasin, A. dan David, J.R.(2015) . Dalam spesies biaya reproduksi mempengaruhi asimetri satirisasi di Drosophila. J Evol Biol [Epub sebelum dicetak]. ID PubMed: 26538290
Ringkasan:
Memahami bagaimana interaksi spesies mempengaruhi distribusi dan evolusi mereka adalah pertanyaan mendasar dalam biologi evolusioner. Teori menunjukkan bahwa gangguan reproduksi asimetris, di mana satu spesies menginduksi biaya reproduksi yang lebih tinggi pada spesies lain, mungkin lebih penting dalam membatasi batas spesies daripada kompetisi interspesifik atas sumber daya. Namun, mekanisme yang mendasari asimetri tersebut masih belum jelas. Penelitian ini menguji apakah perbedaan biaya reproduksi antar spesies menentukan asimetri biaya antar spesies dengan menggunakan tiga spesies Drosophila alopatrik yang termasuk dalam subgrup melanogaster. Hasil mendukung hipotesis ini, terutama pada sepasang spesies pulau. Jantan dari satu spesies yang menyebabkan biaya untuk betina sejenis mereka menyebabkan peningkatan 5 kali lipat kematian betina heterospesifik dengan lalat mati yang membawa luka besar yang spektakuler pada alat kelamin mereka. Jantan dari spesies lain tidak berbahaya bagi betina sejenis maupun heterospesifik. Studi perbandingan dalam biaya reproduksi spesies karena itu dapat menjadi alat yang berharga untuk memprediksi antara interaksi spesies dan struktur komunitas.

Jumat, 11 Desember

Brewer-Jensen, P., Wilson, C. B., Abernethy, J., Mollison, L., Card, S. dan Searles, L. L. (2015) . Penekan sable [Su(s)] dan Wdr82 menurunkan regulasi RNA dari elemen berulang yang dapat diinduksi kejutan panas melalui mekanisme yang melibatkan penghentian transkripsi. RNA [Epub sebelum dicetak]. ID PubMed: 26577379
Ringkasan:
Meskipun RNA polimerase II (Pol II) secara produktif mentranskripsi gen yang sangat panjang in vivo, transkripsi melalui sekuens ekstragenik sering berakhir di daerah promotor-proksimal dan RNA yang baru lahir terdegradasi. Mekanisme yang menginduksi terminasi dini dan degradasi RNA tidak dipahami dengan baik pada organisme multiseluler. Studi ini menyajikan bukti bahwa penekan jalur regulasi sable [su(s)] Drosophila berperan dalam proses ini. Studi sebelumnya telah menunjukkan bahwa Su(s) mempromosikan degradasi transkrip yang dimediasi eksosom dari elemen berulang endogen pada lokus Hsp70 (elemen Hsp70-&alpha&beta). Laporan ini mengidentifikasi Wdr82 sebagai komponen dari proses ini dan menunjukkan bahwa ia bekerja dengan Su(s) untuk menghambat pemanjangan Pol II melalui elemen Hsp70-&alpha&beta. Lebih lanjut, transkrip yang tidak stabil yang dihasilkan selama proses ini terbukti terpoliadenilasi di situs heterogen yang kekurangan sinyal poliadenilasi kanonik. Dua daerah berbeda ditetapkan yang memediasi regulasi ini. Hasil ini menunjukkan bahwa jalur Su(s) mendorong degradasi RNA dan penghentian transkripsi melalui mekanisme baru.

Novak, S. M., Joardar, A., Gregorio, C. C. dan Zarnescu, D. C. (2015) . Regulasi detak jantung di Drosophila melalui protein keterbelakangan mental Fragile X. PLoS One 10: e0142836. ID PubMed: 26571124
Ringkasan:
Protein pengikat RNA memainkan peran penting dalam regulasi ekspresi gen pasca-transkripsi, namun sedikit yang dipahami tentang peran mereka dalam fungsi jantung. Perubahan kadar protein Fragile X Related 1, FXR1, anggota FraX dominan yang diekspresikan dalam otot lurik vertebrata, telah dikaitkan dengan cacat struktural dan fungsional pada model tikus dan ikan zebra. Protein FraX adalah pengatur translasi yang mapan dan diketahui mengatur target spesifik di jaringan yang berbeda. Untuk menguraikan peran langsung protein FraX di jantung in vivo, Drosophila, yang menyimpan satu-satunya protein FraX yang dilestarikan secara fungsional dan diekspresikan di mana-mana, dFmr1, diselidiki. Menggunakan hilangnya alel fungsi klasik serta knockdown RNAi spesifik otot, dFmr1 terbukti diperlukan untuk detak jantung yang tepat selama pengembangan. Analisis fungsional dalam konteks knockdown dFmr1 khusus jantung oleh RNAi menunjukkan bahwa dFmr1 diperlukan sel secara otonom dalam sel jantung untuk mengatur detak jantung. Menariknya, cacat fungsional ini tidak disertai dengan kelainan struktural yang jelas, menunjukkan bahwa dFmr1 dapat mengatur repertoar target yang berbeda di Drosophila daripada di vertebrata. Secara keseluruhan, temuan ini mendukung hipotesis bahwa protein dFmr1 sangat penting untuk fungsi jantung yang tepat dan menetapkan lalat sebagai model baru untuk mempelajari peran protein FraX di jantung.

Kamis, 10 Desember

Winther, A. M., Vorontsova, O., Rees, K. A., Nareoja, T., Sopova, E., Jiao, W. dan Shupliakov, O. (2015) . Protein perancah endositik bersama dengan Synapsin mengatur pengelompokan vesikel sinaptik di persimpangan neuromuskular Drosophila. J Neurosci 35: 14756-14770. ID PubMed: 26538647
Ringkasan:
Banyak protein endositik terakumulasi dalam kumpulan cadangan vesikel sinaptik (SV) di sinapsis dan terlokalisasi ke zona periaktif endositik selama pelepasan neurotransmitter. Saat ini sedikit yang diketahui tentang fungsinya di luar zona periaktif. Studi ini menunjukkan bahwa di persimpangan neuromuskular Drosophila (NMJ), protein perancah endositik Dap160 berkolokasi selama siklus SV dan membentuk kompleks fungsional dengan sinapsin fosfoprotein terkait SV, yang sebelumnya terlibat dalam pengelompokan SV. Interaksi langsung ini penting untuk pelokalan sinapsin yang tepat di NMJ. Di sebuah dap160 penyelamatan mutan yang tidak memiliki interaksi antara Dap160 dan sinapsin, pengelompokan ulang SV yang terganggu selama aktivitas sinaptik diamati. Data menunjukkan bahwa selain fungsi dalam endositosis, Dap160 adalah komponen jaringan interaksi protein-protein yang berfungsi untuk pengelompokan SV dalam hubungannya dengan sinapsin. Selama siklus SV, Dap160 berinteraksi dengan sinapsin yang tersebar dari SV dan membantu mengarahkan sinapsin kembali ke vesikel.

Gireud, M., Sirisaengtaksin, N., Tsunoda, S. dan Bean, A. J. (2015) . Rekonstitusi bebas sel dari penyortiran kargo multivesicular body (MVB). Jurnal-Metode Mol Biol 1270: 115-124. ID PubMed: 25702113
Ringkasan:
Aktivitas pensinyalan protein membran terlokalisasi permukaan sel terjadi terutama ketika protein ini terletak di membran plasma tetapi, dalam beberapa kasus, tidak dihentikan sampai protein terdegradasi. Setelah internalisasi dan pergerakan melalui jalur endositik dalam perjalanan ke lisosom, protein membran transit organel endosom akhir yang disebut badan multivesikular (MVB). MVB dibentuk oleh invaginasi membran pembatas endosom, menghasilkan organel yang memiliki membran pembatas dan mengandung vesikel internal. Mesin molekuler yang mengatur pemisahan protein membran yang ditujukan untuk degradasi dari yang menghasilkan ekspresi permukaan tidak dipahami dengan baik. Studi ini menyusun kembali peristiwa penyortiran endosom dalam kondisi bebas sel. Keuntungan diambil dari rencana perjalanan protein membran prototipikal, reseptor faktor pertumbuhan Epidermal (EGFR) dan monitor biokimia dirancang untuk pergerakan kargo ke dalam vesikel MVB internal yang umumnya dapat dimodifikasi untuk protein membran lainnya. Karena tidak diketahui bagaimana pembentukan vesikel internal terkait dengan pemilahan kargo, pemeriksaan morfologi menggunakan mikroskop elektron transmisi (TEM) memungkinkan pemantauan terpisah dari pembentukan vesikel. Penelitian ini menentukan bahwa pemilahan MVB bergantung pada komponen sitosol, adenosin trifosfat (ATP), waktu, suhu, dan gradien proton yang utuh. Pengujian ini menyusun kembali pematangan endosom akhir dan memungkinkan pemeriksaan morfologi dan biokimia pembentukan vesikel dan pemilahan protein membran.

Rabu 9 Desember

Okamoto, N. dan Nishimura, T. (2015). Sinyal dari neuron glia dan kolinergik mengontrol produksi peptida seperti insulin yang bergantung pada nutrisi untuk pertumbuhan tubuh Drosophila. Sel Pengembang 35: 295-310. ID PubMed: 26555050
Ringkasan:
Keluarga insulin-like peptide (ILP) memainkan peran biologis kunci dalam mengontrol pertumbuhan tubuh. Meskipun fungsi ILP dipahami dengan baik, mekanisme yang organisme merasakan status nutrisi mereka dan dengan demikian mengontrol produksi ILP sebagian besar masih belum diketahui. Studi ini menunjukkan bahwa relai pensinyalan dan mekanisme umpan balik mengontrol ekspresi Drosophila ILP5 (Dilp5) yang bergantung pada nutrisi. Ekspresi dari dilp5 dalam sel penghasil insulin otak (IPC) diatur secara negatif oleh faktor transkripsi FoxO. Dilp6 yang diturunkan dari glia mengatur aktivitas FoxO dari jarak jauh di IPC, terutama melalui Jeb yang disekresikan oleh neuron kolinergik. Produksi Dilp6 oleh glia permukaan diperkuat oleh respons seluler terhadap Dilps yang bersirkulasi yang berasal dari IPC, bersama dengan sinyal asam amino. induksi dari dilp5 sangat penting untuk mempertahankan pertumbuhan tubuh di bawah kondisi makanan terbatas. Hasil ini memberikan kerangka molekuler yang menjelaskan bagaimana produksi hormon endokrin dalam jaringan tertentu dikoordinasikan dengan kondisi lingkungan.

Pahi, Z., Kiss, Z., Komonyi, O., Borsos, B. N., Tora, L., Boros, I. M. dan Pankotai, T. (2015) . Kompleks yang mengandung dTAF10 dan dTAF10b diperlukan untuk morfogenesis larva-pupa yang digerakkan oleh ecdysone di Drosophila melanogaster. PLoS One 10: e0142226. ID PubMed: 26556600
Ringkasan:
Pada eukariota, kompleks TFIID diperlukan untuk perakitan kompleks prainisiasi yang memposisikan RNA polimerase II di sekitar lokasi awal transkripsi. Kompleks histon asetiltransferase termasuk SAGA dan ATAC, memodulasi transkripsi pada beberapa langkah melalui modifikasi residu histon inti spesifik. Penelitian ini menyelidiki fungsi protein Drosophila TAF10 dan TAF10b, yang masing-masing merupakan subunit dari dTFIID dan dSAGA. Penghapusan simultan dari kedua gen dTaf10 mengganggu perekrutan subunit dTFIID dTAF5 ke kromosom polytene, sementara pengikatan subunit TFIID lainnya, RNAPII tidak terpengaruh. Kurangnya kedua protein dTAF10 mengakibatkan kegagalan dalam transisi larva-pupa selama metamorfosis dan pemrograman ulang transkripsi pada tahap perkembangan ini. Yang penting, fenotipe yang dihasilkan dari mutasi dTaf10+dTaf10b dapat diselamatkan oleh ecdysone yang ditambahkan secara ektopik, menunjukkan bahwa kompleks yang mengandung dTAF10- dan/atau dTAF10b terlibat dalam ekspresi gen biosintetik ecdysone. Data ini mendukung gagasan bahwa keberadaan protein dTAF10 dalam dTFIID dan/atau dSAGA hanya diperlukan pada langkah-langkah perkembangan tertentu. Diusulkan bahwa bentuk dTFIID dan/atau dSAGA yang berbeda ada selama metamorfosis Drosophila, di mana komposisi TAF yang berbeda berfungsi untuk menargetkan RNAPII pada tahap perkembangan dan jaringan yang berbeda.

Selasa, 8 Desember

Wu, Y., Lindblad, J. L., Garnett, J., Kamber Kaya, H. E., Xu, D., Zhao, Y., Flores, E. R., Hardy, J. dan Bergmann, A. (2015) . Karakterisasi genetik dari dua alel gain-of-fungsi dari efektor caspase DrICE di Drosophila. Kematian Sel Berbeda. ID PubMed: 26542461
Ringkasan:
Caspases adalah eksekutor apoptosis. Meskipun banyak yang diketahui tentang peran dan struktur fisiologisnya, analisis terperinci tentang mutasi missense caspases masih kurang. Karena mutasi dalam caspases diidentifikasi dalam berbagai penyakit manusia, studi tentang mutan caspase akan membantu menjelaskan bagaimana caspases berinteraksi dengan komponen lain dari jalur apoptosis dan bagaimana mereka dapat berkontribusi pada penyakit. DrICE adalah caspase efektor utama di Drosophila yang diperlukan untuk perkembangan dan kematian sel yang diinduksi stres. Studi ini melaporkan isolasi dan karakterisasi enam mutan de novo drICE, yang semuanya membawa mutasi titik yang mempengaruhi asam amino yang dilestarikan di antara caspases di berbagai spesies. Keenam mutan ini berperilaku sebagai mutan kehilangan fungsi resesif dalam kondisi homozigot. Anehnya, bagaimanapun, dua dari alel drICE yang baru diisolasi adalah mutan gain-of-function dalam kondisi heterozigot, meskipun mereka adalah mutan-mutan loss-of-function secara homozigot. Menariknya, mereka hanya berperilaku sebagai mutan gain-of-function dengan adanya sinyal apoptosis. Kedua alel ini membawa mutasi missense yang mempengaruhi asam amino yang disimpan di dekat residu sistein katalitik. Hasil ini memberikan pengecualian yang signifikan terhadap harapan bahwa mutasi asam amino yang dilestarikan selalu menghapus aktivitas pro-apoptosis caspases.

Joffre, C., dkk. (2015). STK38 kinase pro-apoptosis adalah mitra Beclin1 baru yang secara positif mengatur autophagy. Curr Biol 25: 2479-2492. ID PubMed: 26387716
Ringkasan:
Autophagy memainkan peran kunci dalam perkembangan, onkogenesis, penyakit kardiovaskular, metabolisme, dan neurodegeneratif. Studi ini menjelaskan protein kinase STK38 (juga disebut NDR1 dan Tricornered di Drosophila) sebagai pengatur autophagy yang dilestarikan. STK38 ditemukan sebagai mitra pengikat baru Beclin1 (Atg6 lihat Drosophila Atg6), pengatur utama autophagy. STK38 mempromosikan pembentukan autophagosome dalam sel manusia dan di Drosophila. Setelah induksi autophagy, sel-sel yang terkuras STK38 menampilkan gangguan konversi LC3B-II mengurangi pembentukan puncta ATG14L, ATG12, dan WIPI-1 dan secara signifikan menurunkan aktivitas Vps34 (Pi3K59F dalam Drosophila), sebagaimana dinilai oleh pembentukan PI3P. Lebih lanjut, diamati bahwa STK38 mendukung interaksi komponen eksokista Exo84 dengan Beclin1 dan RalB, yang diperlukan untuk memulai pembentukan autophagosome. Setelah mempelajari aktivasi STK38 selama induksi autophagy, STK38 ditemukan distimulasi dengan cara yang bergantung pada MOB1 dan eksokista. Sebaliknya, penipisan RalB memicu hiperaktivasi STK38, menghasilkan apoptosis yang bergantung pada STK38 dalam kondisi autophagy yang berkepanjangan. Bersama-sama, data ini menetapkan STK38 sebagai pengatur autophagy yang dilestarikan dalam sel manusia dan lalat. Bukti juga diberikan yang menunjukkan bahwa STK38 dan RalB membantu koordinasi antara peristiwa autophagic dan apoptosis pada induksi autophagy, sehingga selanjutnya mengusulkan peran STK38 dalam menentukan nasib seluler sebagai respons terhadap kondisi autophagic.

Senin, 7 Desember

Loedige, I., Jakob, L., Treiber, T., Ray, D., Stotz, M., Treiber, N., Hennig, J., Cook, KB, Morris, Q., Hughes, TR, Engelmann, JC, Krahn, MP dan Meister, G. (2015). Struktur kristal domain NHL dalam kompleks dengan RNA mengungkapkan dasar molekuler regulasi gen yang dimediasi tumor otak Drosophila. Perwakilan Sel 13: 1206-1220. ID PubMed: 26527002
Ringkasan:
Protein TRIM-NHL dilestarikan di antara metazoa dan mengontrol keputusan nasib sel di berbagai garis keturunan sel induk. Protein Drosophila TRIM-NHL Tumor otak (Brat) mengarahkan diferensiasi sel induk saraf dengan menekan faktor pembaruan diri. Brat adalah protein pengikat RNA dan berfungsi sebagai penekan translasi. Namun, tidak diketahui RNA mana yang diatur Brat dan bagaimana spesifisitas pengikatan RNA dicapai. Menggunakan imunopresipitasi RNA dan RNAcompete, penelitian ini mengidentifikasi mRNA yang terikat Brat dalam embrio Drosophila dan menentukan motif pengikatan konsensus untuk Brat serta sejumlah protein TRIM-NHL tambahan, yang menunjukkan bahwa protein TRIM-NHL dilestarikan, pengikatan RNA spesifik-urutan protein. Represi yang dimediasi anak nakal dan pengikatan RNA langsung bergantung pada motif yang diidentifikasi dan menunjukkan bahwa pengikatan faktor lokalisasi Miranda ke domain Brat-NHL menghambat aktivitas Brat. Akhirnya, untuk mengungkap spesifisitas urutan domain NHL, domain Brat-NHL dalam kompleks dikristalisasi dengan RNA, dan struktur protein-RNA resolusi tinggi dari lipatan ini disajikan.

Yue, Y., Yang, Y., Dai, L., Cao, G., Chen, R., Hong, W., Liu, B., Shi, Y., Meng, Y., Shi, F., Xiao, M. dan Jin, Y. (2015). Pasangan RNA jarak jauh berkontribusi pada penyambungan yang saling eksklusif. RNA [Epub sebelum dicetak]. ID PubMed: 26554032
Ringkasan:
Penyambungan yang saling eksklusif adalah cara penting untuk meningkatkan repertoar protein, di mana gen molekul adhesi sel sindrom Down (Dscam) berpotensi menghasilkan 38.016 isoform berbeda dalam Drosophila melanogaster. Namun, mekanisme pengaturan tetap tidak jelas karena kompleksitas kluster ekson Dscam. Studi ini mengungkapkan model molekuler untuk regulasi penyambungan yang saling eksklusif dari ular pra-mRNA berdasarkan persaingan antara pasangan RNA hulu dan hilir. Pasangan RNA ganda semacam itu memberikan penyetelan yang baik dari penyertaan ekson alternatif. Selain itu, hasil penyambungan ekson alternatif dimediasi dalam mode korelasi kekuatan pasangan relatif. Analisis genomik komparatif gabungan dan bukti eksperimental mengungkapkan arsitektur struktural dua arah yang serupa dalam kluster ekson 4 dan 9 dari gen Dscam. Temuan ini memberikan kerangka kerja mekanistik baru untuk regulasi penyambungan yang saling eksklusif dan mungkin menawarkan wawasan yang berpotensi dapat diterapkan ke dalam interaksi RNA-RNA jarak jauh dalam jaringan regulasi gen.

Minggu, 6 Desember

Hall, E. T. dan Verheyen, E. M. (2015) . Dsor1 yang diaktifkan oleh ras mempromosikan pensinyalan Wnt dalam pengembangan Drosophila. Ilmu Sel J. [Epub sebelum dicetak]. ID PubMed: 26542023
Ringkasan:
Pensinyalan Wnt/Wingless (Wg) dan Ras/MAPK keduanya memainkan peran mendasar dalam pertumbuhan, penentuan nasib sel, dan ketika disregulasi, dapat menyebabkan tumorigenesis. Beberapa mode interaksi yang saling bertentangan antara pensinyalan Ras / MAPK dan Wnt telah diidentifikasi dalam konteks seluler tertentu, menyebabkan efek sinergis atau antagonis pada gen target. Studi ini menemukan bukti baru bahwa kinase spesifisitas ganda Hilir Raf1 (Dsor1), juga dikenal sebagai MEK. diperlukan untuk pensinyalan Wnt. Knockdown Dsor1 menghasilkan hilangnya ekspresi gen target Tanpa Sayap, serta pengurangan Armadillo (Arm Drosophila beta-catenin) yang distabilkan. Interaksi fisik yang erat ditemukan antara Dsor1 dan Arm yang secara katalitik tidak aktif Dsor1 menyebabkan pengurangan Arm yang tidak aktif. Hasil ini menunjukkan bahwa Dsor1 biasanya melawan penghancuran Arm yang dimediasi Axin. Aktivitas Ras-Dsor1 tidak tergantung pada aktivasi hulu oleh EGFR, melainkan tampaknya diaktifkan oleh reseptor faktor pertumbuhan seperti insulin untuk mempromosikan pensinyalan Wg. Bersama-sama hasil kami menyarankan crosstalk baru antara insulin dan pensinyalan Wg melalui Dsor1.

Lin, Y. H., Currinn, H., Pocha, S. M., Rothnie, A., Wassmer, T. dan Knust, E. (2015) . Endositosis yang dimediasi kompleks AP-2 dari Drosophila Crumbs mengatur polaritas melalui Stardust yang memusuhi. J Cell Sci [Epub sebelum dicetak]. ID PubMed: 26527400
Ringkasan:
Pemeliharaan polaritas epitel tergantung pada lokalisasi yang benar dan tingkat penentu polaritas. Protein transmembran yang dilestarikan secara evolusioner Remah sangat penting untuk ukuran dan identitas membran apikal, namun sedikit yang diketahui tentang mekanisme molekuler yang mengendalikan jumlah Remah di permukaan. Studi ini menunjukkan bahwa tingkat Remah pada membran apikal tergantung pada keadaan endositosis dan stabilisasi yang seimbang. Kompleks Adaptor Protein 2 (AP-2) berikatan dengan motif di ekor sitoplasma Remah yang tumpang tindih dengan tempat pengikatan Stardust, protein yang diketahui menstabilkan Remah di permukaan.Mencegah endositosis dengan mutasi pada AP-2 menyebabkan perluasan membran plasma Crumbs-positif dan defek polaritas, yang sebagian dapat diselamatkan dengan menghapus satu salinan dari remah-remah. Menariknya, merobohkan AP-2 dan Stardust mempertahankan Remah pada membran. Studi ini memberikan bukti untuk mekanisme molekuler, berdasarkan stabilisasi dan endositosis, untuk menyesuaikan tingkat permukaan Remah, yang penting untuk menjaga polaritas epitel.

Sabtu, 5 Desember

Wu, Y., Gause, M., Xu, D., Misulovin, Z., Schaaf, CA, Mosarla, RC, Mannino, E., Shannon, M., Jones, E., Shi, M., Chen, WF, Katz, OL, Sehgal, A., Jongens, TA, Krantz, ID dan Dorsett, D. (2015) . Model mutan Drosophila Nipped-B Sindrom Cornelia de Lange dalam pertumbuhan dan perilaku. PLoS Genet 11: e1005655. ID PubMed: 26544867
Ringkasan:
Individu dengan Cornelia de Lange Syndrome (CdLS) menunjukkan defisit perkembangan yang beragam, termasuk pertumbuhan yang lambat, kelainan anggota tubuh dan organ multipel, dan cacat intelektual. Individu yang terkena dampak parah paling sering memiliki mutasi kehilangan fungsi yang dominan pada gen Nipped-B-Like (NIPBL), dan kasus yang lebih ringan sering memiliki mutasi missense atau penghapusan in-frame pada gen yang mengkode subunit kompleks kohesin. Cohesin memediasi kohesi kromatid saudara perempuan untuk memfasilitasi pemisahan kromosom yang akurat, dan NIPBL diperlukan agar kohesin berikatan dengan kromosom. Individu dengan CdLS, bagaimanapun, tidak menunjukkan cacat kohesi atau segregasi yang jelas. Sebaliknya, studi pada sel manusia dan organisme model menunjukkan bahwa penurunan sederhana dalam aktivitas NIPBL dan kohesin mengubah transkripsi banyak gen yang mengatur pertumbuhan dan perkembangan. Faktor kohesi kromatid saudara perempuan, termasuk ortolog Nipped-B dari NIPBL manusia, juga penting untuk ekspresi dan perkembangan gen pada Drosophila melanogaster. Studi ini menjelaskan bagaimana pengurangan sederhana dalam aktivitas Nipped-B mengubah pertumbuhan dan fungsi neurologis di Drosophila. Studi ini mengungkapkan bahwa Drosophila mutan heterozigot Nipped-B menunjukkan penurunan pertumbuhan, pembelajaran, dan memori, dan ritme sirkadian yang berubah. Yang penting, defisit pertumbuhan tidak disebabkan oleh perubahan dalam kontrol pertumbuhan sistemik, tetapi pengurangan jumlah dan ukuran sel yang sebagian disebabkan oleh berkurangnya ekspresi myc (kecil) dan gen pengatur pertumbuhan lainnya. Defisit belajar, memori dan sirkadian disertai dengan kelainan morfologi pada struktur otak. Studi-studi ini mengkonfirmasi bahwa mutan Drosophila Nipped-B memberikan model yang berguna untuk memahami CdLS, dan memberikan wawasan baru tentang asal-usul cacat lahir.

Wang, X., Perumalsamy, H., Kwon, H. W., Na, Y. E. dan Ahn, Y. J. (2015) . Efek dan kemungkinan mekanisme aksi acacetin pada perilaku dan morfologi mata model Drosophila penyakit Alzheimer. Sci Rep 5: 16127. PubMed ID: 26530776
Ringkasan:
Enzim pembelahan beta-amiloid manusia (A&beta lihat Drosophila Appl) (BACE-1) adalah target untuk perawatan penyakit Alzheimer (AD). Penelitian ini dilakukan untuk menentukan apakah acacetin yang diekstraksi dari seluruh tanaman Agastache rugosa memiliki aktivitas anti-BACE-1 dan perilaku pada model Drosophila AD dan untuk menentukan mekanisme aksi acacetin. Acacetin menyelamatkan lalat yang mengekspresikan APP/BACE1 dan mencegah mereka mengembangkan cacat morfologi mata dan perilaku. Analisis rtPCR mengungkapkan bahwa acacetin mengurangi tingkat mRNA APP dan BACE-1 manusia pada lalat transgenik, menunjukkan bahwa acacetin memainkan peran penting dalam regulasi transkripsi BACE-1 dan APP manusia. Analisis Western blot mengungkapkan bahwa acacetin mengurangi produksi A&beta dengan mengganggu aktivitas BACE-1 dan sintesis APP, menghasilkan penurunan level fragmen terminal karboksi APP dan domain intraseluler APP. Oleh karena itu, efek perlindungan acacetin pada produksi A&beta dimediasi oleh regulasi transkripsi BACE-1 dan APP, menghasilkan penurunan ekspresi protein APP dan aktivitas BACE-1. Acacetin juga menghambat sintesis APP, menghasilkan penurunan jumlah plak amiloid.

Landry, G. M., Hirata, T., Anderson, J. B., Cabrero, P., Gallo, C. J., Dow, J. A. dan Romero, M. F. (2015) . Sulfat dan tiosulfat menghambat transportasi oksalat melalui mekanisme yang bergantung pada dPrestin(mSlc26a6) dalam model serangga nefrolitiasis kalsium oksalat. Am J Physiol Renal Physiol: ajprenal 00406 02015. PubMed ID: 26538444
Ringkasan:
Nefrolitiasis merupakan salah satu gangguan saluran kemih yang paling umum dengan mayoritas batu ginjal terdiri dari kalsium oksalat (CaOx). Mengingat prevalensinya (US kejadian 10%), masih kurang dipahami, kurang kemajuan dalam mengidentifikasi terapi baru karena etiologi yang kompleks. Drosophila adalah model nefrolitiasis CaOx yang dikembangkan baru-baru ini. Efek sulfat dan tiosulfat pada pembentukan kristal diselidiki menggunakan model Drosophila, serta efek elektrofisiologis pada kedua pengangkut oksalat Drosophila (Slc26a5/6 dprestin) dan tikus (mSlc26a6) menggunakan sistem ekspresi heterolog oosit Xenopus. Hasil menunjukkan bahwa keduanya mengangkut tiosulfat dengan afinitas yang jauh lebih tinggi daripada sulfat. Selain itu, kedua senyawa tersebut efektif dalam menurunkan kristalisasi CaOx ketika ditambahkan ke dalam pakan. Namun, hasil ini tidak diamati ketika senyawa diterapkan pada MTs ex vivo. Tidak ada senyawa yang mempengaruhi kristalisasi CaOx pada hewan knock down dPrestin yang menunjukkan peran dPrestin spesifik sel utama dalam transportasi oksalat luminal. Selanjutnya, tiosulfat memiliki afinitas yang lebih tinggi terhadap dPrestin dan mSlc26a6 dibandingkan dengan oksalat Data ini menunjukkan bahwa kemampuan tiosulfat untuk bertindak sebagai inhibitor kompetitif oksalat melalui dPrestin, dapat menjelaskan penurunan kristalisasi CaOx yang terlihat dengan adanya tiosulfat, tetapi tidak dengan sulfat. Secara keseluruhan, temuan ini memprediksi bahwa tiosulfat atau oksalat-mimik mungkin efektif sebagai inhibitor kompetitif terapeutik kristalisasi CaOx.

Jumat, 4 Desember

Zielke, T., Glotov, A. dan Saumweber, H. (2015). Analisis hibridisasi in situ resolusi tinggi pada interval kromosom 61C7-61C8 dari Drosophila melanogaster mengungkapkan interbands sebagai domain kromatin terbuka. Chromosoma [Epub sebelum dicetak]. ID PubMed: 26520107
Ringkasan:
Kromatin eukariotik diatur dalam domain yang berdekatan yang berbeda dalam pengikatan protein, modifikasi histon, aktivitas transkripsi, dan dalam tingkat pemadatannya. Perbandingan luas genom menunjukkan bahwa, secara keseluruhan, organisasi kromatin serupa dalam sel yang berbeda dalam suatu organisme. Penelitian ini membandingkan struktur dan aktivitas interval 61C7-61C8 pada sel polytene dan diploid Drosophila. Dengan hibridisasi in situ pada kromosom polytene yang dikombinasikan dengan mikroskop resolusi tinggi, batas-batas dipetakan dari interband 61C7-8 dan daerah pita 61C7 dan C8, masing-masing. Hasilnya menunjukkan bahwa interband 61C7-8 secara signifikan lebih besar dari perkiraan sebelumnya. Interband ini meluas lebih dari 20 kbp dan berada dalam kisaran domain band mengapit. Ini berisi beberapa gen aktif dan karena itu dapat dianggap sebagai domain kromatin terbuka. Membandingkan struktur 61C7-8 sel Drosophila S2 dan sel kelenjar ludah polytene oleh ChIP untuk pengikatan protein kromatin dan modifikasi histone, struktur domain yang sangat konsisten diamati untuk 13 kbp proksimal domain di kedua jenis sel. Namun, 7 kbp distal dari domain terbuka berbeda dalam pengikatan protein dan modifikasi histon antara kedua jaringan. Domain berisi empat gen pengkode protein di bagian proksimal dan dua transkrip nonkode di bagian distal. Aktivitas transkripsi diferensial dari salah satu transkrip noncoding berkorelasi dengan perbedaan yang diamati dalam struktur kromatin antara kedua jaringan.

Panikar, C. S., Rajpathak, S. N., Abhyankar, V., Deshmukh, S. dan Deobagkar, D. D. (2015) . Kehadiran aktivitas DNA methyltransferase dan metilasi CpC di Drosophila melanogaster. Mol Biol Rep 42: 1615-1621. ID PubMed: 26547851
Ringkasan:
Lalat tidak memiliki mesin metilasi berbasis DNMT1/DNMT3. Meskipun laporan terbaru mengkonfirmasi adanya metilasi DNA rendah di Drosophila, sedikit yang diketahui tentang metiltransferase. Studi ini menyelidiki kemungkinan fungsi DNA methyltransferase di Drosophila. Slide microarray oligo 14 K diinkubasi dengan ekstrak sel asli dari Drosophila dewasa untuk memeriksa adanya aktivitas methyltransferase. Urutan oligo termetilasi kemudian diidentifikasi dengan pengikatan antibodi monoklonal anti 5-metilsitosin. PCR yang dimediasi enzim restriksi sensitif metilasi digunakan untuk menilai metilasi pada beberapa lokus terpilih yang diidentifikasi pada susunan. Beberapa oligo total terlihat termetilasi di bawah kondisi pengujian. Bukti disediakan untuk adanya aktivitas de novo methyltransferase dan identifikasi spesifisitas urutannya. Kehadiran metilasi CpC terdeteksi di wilayah genomik yang dipilih. Studi ini memberikan pendekatan inovatif untuk menyelidiki spesifisitas metilasi dari methyltransferase asli.

Kamis, 3 Desember

Tiwari, P., Kumar, A., Das, R. N., Malhotra, V. dan VijayRaghavan, K. (2015). Layar RNAi spesifik sel tendon mengungkapkan kandidat baru yang penting untuk interaksi tendon otot. PLoS One 10: e0140976. ID PubMed: 26488612
Ringkasan:
Tendon adalah jaringan ikat fibrosa yang menghubungkan otot ke elemen rangka sehingga bertindak sebagai pemancar pasif kekuatan selama penggerak dan memberikan postur tubuh yang sesuai. Isyarat yang diturunkan dari tendon, meskipun kurang dipahami, diperlukan untuk bimbingan dan perlekatan otot yang tepat selama perkembangan. Penelitian ini menggunakan otot longitudinal dorsal Drosophila dan tempat perlekatan tendonnya untuk mengungkap sifat molekuler interaksi antara otot dan tendon. Penyaringan genetik menggunakan knockdown yang dimediasi RNAi dalam sel tendon dilakukan untuk mengetahui pemain molekuler yang terlibat dalam pembentukan dan pemeliharaan kandidat sambungan myotendinous 21 ditemukan dari 2507 garis RNAi yang disaring. Dari jumlah tersebut, 19 adalah molekul baru dalam konteks sistem myotendinous. Integrin-&betaPS dan Talin, dipilih sebagai kandidat di layar ini, diketahui memainkan peran penting dalam interaksi sel-sel dan pembentukan sambungan myotendinous yang memvalidasi layar. Kandidat ditemukan dengan fungsi enzimatik, aktivitas transkripsi, adhesi sel, pelipatan protein dan fungsi transpor intraseluler. Tango1, protein keluar ER yang terlibat dalam sekresi kolagen diidentifikasi sebagai molekul kandidat yang terlibat dalam pembentukan sambungan myotendinous. Tango1 knockdown ditemukan mempengaruhi perkembangan situs perlekatan otot dan pembentukan sambungan myotendinous. Tango1 juga ditemukan terlibat dalam sekresi Viking (Kolagen tipe IV) dan BM-40 dari hemosit dan sel lemak.

Flores-Benitez, D. dan Knust, E. (2015). Remah adalah pengatur penting dinamika sitoskeletal dan adhesi sel-sel selama penutupan punggung di Drosophila. Elife 4 [Epub sebelum dicetak]. ID PubMed: 26544546
Ringkasan:
Protein Remah yang dilestarikan secara evolusioner diperlukan untuk polaritas epitel dan morfogenesis. Studi ini mengidentifikasi peran baru Crumbs sebagai pengatur negatif dinamika actomyosin selama penutupan punggung pada embrio Drosophila. Embrio yang membawa mutasi pada motif pengikatan domain FERM (protein 4.1/ezrin/radixin/moesin) dari Crumbs mati karena jaringan aktomiosin yang terlalu aktif terkait dengan persimpangan adherens yang terganggu. Fenotipe ini terbatas pada amnioserosa dan tidak mempengaruhi epitel embrionik lainnya. Fungsi Remah ini membutuhkan DMoesin, Rho1-GTPase, kinase teraktivasi p21 kelas-I dan kompleks Arp2/3. Data yang disajikan di sini menunjukkan peran penting Remah dalam mengatur dinamika aktomiosin, sambungan sel, dan morfogenesis.

Rabu, 2 Desember

Bailey, A. P., Koster, G., Guillermier, C., Hirst, E. M., MacRae, J. I., Lechene, C. P., Postle, A. D. dan Gould, A. P. (2015) . Peran Antioksidan untuk tetesan lipid dalam ceruk sel induk Drosophila. Sel 163: 340-353. ID PubMed: 26451484
Ringkasan:
Sel induk berada di lingkungan mikro khusus yang dikenal sebagai relung. Selama perkembangan Drosophila, sel glial menyediakan ceruk yang menopang proliferasi sel induk saraf (neuroblas) selama kelaparan. Studi ini menemukan bahwa ceruk sel glial juga mempertahankan proliferasi neuroblas dalam kondisi hipoksia dan stres oksidatif. Tetesan lipid yang terbentuk di niche glia selama stres oksidatif membatasi tingkat spesies oksigen reaktif (ROS) dan menghambat oksidasi asam lemak tak jenuh ganda (PUFA). Tetesan ini melindungi glia dan juga neuroblas dari reaksi berantai peroksidasi yang dapat merusak berbagai jenis makromolekul. Mekanisme antioksidan yang mendasari melibatkan pengalihan PUFA, termasuk asam linoleat yang diturunkan dari makanan, menjauh dari membran ke inti tetesan lipid, di mana mereka kurang rentan terhadap peroksidasi. Studi ini mengungkapkan peran antioksidan untuk tetesan lipid yang mungkin relevan dalam banyak konteks biologis yang berbeda.

Fu, Z., Geng, C., Wang, H., Yang, Z., Weng, C., Li, H., Deng, L., Liu, L., Liu, N., Ni, J. dan Xie, T. (2015). Twin mempromosikan pemeliharaan dan diferensiasi garis keturunan sel induk germline melalui modulasi beberapa jalur. Perwakilan Sel 13: 1366-1379. ID PubMed: 26549449
Ringkasan:
Pertanyaan sentral dalam regulasi sel punca adalah bagaimana keseimbangan antara pembaruan diri dan diferensiasi dikendalikan pada tingkat molekuler. Studi ini menggunakan sel punca germline (GSC) di ovarium Drosophila untuk menunjukkan bahwa Kembar homolog Drosophila CCR4 diperlukan secara intrinsik untuk mempromosikan pembaruan diri GSC dan diferensiasi keturunan. Twin/CCR4 adalah salah satu dari dua subunit katalitik dalam kompleks CCR4-NOT mRNA deadenylase yang sangat terkonservasi. Twin bekerja dalam kompleks CCR4-NOT untuk secara intrinsik mempertahankan pembaruan diri GSC, setidaknya sebagian dengan mempertahankan interaksi ceruk GSC yang dimediasi E-cadherin dan mencegah kerusakan DNA yang diinduksi elemen transposable. Ini mempromosikan diferensiasi keturunan GSC dengan membentuk kompleks protein dengan faktor diferensiasi Bam dan Bgcn secara independen dari komponen CCR4-NOT lainnya. Menariknya, Bam dapat secara kompetitif menghambat asosiasi Twin dengan Pop2 di kompleks CCR4-NOT. Oleh karena itu, penelitian ini menunjukkan bahwa Twin memiliki peran intrinsik yang penting dalam mempromosikan pembaruan diri GSC dan diferensiasi keturunan dengan berfungsi dalam kompleks protein yang berbeda.

Selasa, 1 Desember

Takemura, S.Y., dkk. (2015). Sirkuit sinaptik dan variasinya dalam kolom yang berbeda dalam sistem visual Drosophila. Jurnal-Proc Natl Acad Sci U S A 112: 13711-13716. ID PubMed: 26483464
Ringkasan:
Studi ini merekonstruksi sirkuit sinaptik dari tujuh kolom di neuropil atau medula kedua di belakang mata majemuk lalat. Neuron ini mewujudkan beberapa sirkuit yang paling stereotip di salah satu otak hewan yang paling mini. Rekonstruksi memungkinkan studi variasi antara sirkuit di kolom tetangga medula. Variasi dalam jumlah sinapsis dan jenis mitra sinaptiknya sebelumnya telah sedikit dibahas karena metode yang memvisualisasikan beberapa sirkuit belum menyelesaikan koneksi terperinci, dan studi konektivitas yang ada, yang dapat melihat koneksi semacam itu, sejauh ini belum memeriksa beberapa rekonstruksi sirkuit yang sama. Studi ini membahas penghilangan dengan membandingkan sirkit yang umum untuk ketujuh kolom untuk menilai variasi dalam kekuatan sambungannya dan tingkat resultan dari beberapa jenis kesalahan sambungan yang berbeda dan berbeda. Tingkat kesalahan mengungkapkan bahwa, secara keseluruhan, : lt1% dari kontak bukan bagian dari rangkaian konsensus, dan kontak yang melengkapi (E+) atau hilang darinya (E-) diklasifikasikan. Autapses, di mana sel yang sama adalah presinaptik dan postsinaptik pada sinapsis yang sama, kadang-kadang terlihat dua sel khususnya, Dm9 dan Mi1, membentuk >/=20 kali lipat lebih banyak autapsis daripada neuron lain. Hasil ini membatasi keakuratan peristiwa perkembangan yang membentuk dan secara normal memelihara sirkuit sinaptik dengan presisi seperti itu, dan dengan demikian menangani pengoperasian sirkuit tersebut. Mereka juga menetapkan preseden untuk tingkat kesalahan yang akan diperlukan dalam ilmu baru konektivitas.

Kim, H., Choi, M. S., Kang, K. dan Kwon, J. Y. (2015) . Analisis perilaku persepsi rasa pahit pada larva Drosophila. Chem Senses [Epub sebelum dicetak]. ID PubMed: 26512069
Ringkasan:
Larva serangga, yang mengenali sumber makanan melalui isyarat kemosensor, merupakan sumber utama kerugian pertanian global. Gustation adalah faktor penting yang menentukan perilaku makan, dan reseptor gustatory (Grs) bertindak sebagai reseptor molekuler yang mengenali beragam bahan kimia di neuron reseptor gustatory (GRNs). Perilaku larva Drosophila relatif lebih sederhana daripada lalat dewasa, dan peta reseptor-ke-neuron gustatory dibuat dalam penelitian sebelumnya tentang organ sensorik kepala larva eksternal utama. Studi ini secara ekstensif meneliti respon rasa pahit larva menggunakan uji perilaku 2 pilihan. Pertama, panel yang terdiri dari 23 kandidat senyawa pahit diuji untuk membandingkan respons perilaku larva dan dewasa. Sembilan senyawa pahit diuji, yang menimbulkan perilaku permusuhan dengan cara yang bergantung pada dosis. Peta fungsional GRN larva dibangun dengan menggunakan garis Gr-GAL4 yang mendorong ekspresi toksin UAS-tetanus dan UAS-VR1 dalam neuron pengecap tertentu untuk mengidentifikasi kombinasi rasa pahit-GRN dengan menekan dan mengaktifkan subset terpisah dari neuron rasa, masing-masing. Hasilnya menunjukkan bahwa banyak neuron pengecap bertindak kooperatif dalam penginderaan pahit larva, dan bahwa neuron ini memiliki tingkat respons yang berbeda terhadap senyawa pahit yang berbeda.